RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W PSO2P30620 661 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RPC25P35718 212 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CCT2P39076 527 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W TRS85P46944 698 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W AVT4P50944 713 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W ART5P53244 586 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W MSO1P53604 210 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W TOF1P53840 1238 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SOV1Q04748 898 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YLR287CQ05881 355 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YLL056CQ12177 298 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SCM3Q12334 223 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CEX1Q12453 761 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YCL021W-AQ96VH3 125 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RPL3P14126 387 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W IDH2P28241 369 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W NFU1P32860 256 aa3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W NIP100P33420 868 aa3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CBP4P37267 147 aa3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W APE3P37302 537 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W AVT5P38176 459 aa3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W GAA1P39012 614 aa3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W DLD2P46681 530 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W LIF1P53150 421 aa3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W PIR3Q03180 325 aa3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SCW10Q04951 389 aa3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W MMR1Q06324 491 aa3.3□□□□□ -1.88
THP2YHR167W HIP1P06775 603 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W MAS2P11914 482 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CLN3P13365 580 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W PMR1P13586 950 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W OM45P16547 393 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SNT1P25357 1226 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W NDI1P32340 513 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W GLC7P32598 312 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YKT6P36015 200 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SIP3P38717 1229 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W ISC1P40015 477 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W GPD2P41911 440 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W VTC2P43585 828 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W TOS3P43637 560 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W FYV8P46949 817 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YJL132WP47014 750 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W VTA1Q06263 330 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SIL1Q08199 421 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YOL075CQ08234 1294 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W HNT3Q08702 217 aa3.29□□□□□ -1.88
THP2YHR167W GPH1P06738 902 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CHS1P08004 1131 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RIP1P08067 215 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SEC63P14906 663 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YCR100CP25606 316 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RML2P32611 393 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W GYP6P32806 458 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RSM22P36056 628 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W JNM1P36224 373 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YGL138CP53122 345 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RMD9P53140 646 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W ODC1Q03028 310 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YMR155WQ03795 547 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SPH1Q06160 661 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SHS1Q07657 551 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YPL150WQ12152 901 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W ERP3Q12403 225 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YER078W-AQ3E7A2 54 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W ISN1Q99312 450 aa3.28□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CPR1P14832 162 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W CBS2P14905 389 aa3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W CLB3P24870 427 aa3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W YCR041WP37265 110 aa3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W POP6P53218 158 aa3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W PCP1P53259 346 aa3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W CAF40P53829 373 aa3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.27□□□□□ -1.89not detected
THP2YHR167W PNG1Q02890 363 aa3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W SMC5Q08204 1093 aa3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W SFI1Q12369 946 aa3.27□□□□□ -1.89
THP2YHR167W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
THP2YHR167W FLO1P32768 1537 aa3.26□□□□□ -1.89
THP2YHR167W YAR066WP0CX18 203 aa3.26□□□□□ -1.89
THP2YHR167W YHR214WP0CX19 203 aa3.26□□□□□ -1.89
THP2YHR167W ALG1P16661 449 aa3.26□□□□□ -1.89
THP2YHR167W RPC53P25441 422 aa3.26□□□□□ -1.89
THP2YHR167W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
THP2YHR167W REC114P32841 428 aa3.26□□□□□ -1.89
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