RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	TRK1	P12685	1235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PPH22	P23595	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PET18	P25362	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HCM1	P25364	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PRR1	P28708	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RIB5	P38145	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SEO1	P39709	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	EAF5	P39995	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AVT6	P40074	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CTF18	P49956	741 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YGR017W	P53210	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	VPS62	P53285	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PEX13	P80667	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SAE3	P89114	91 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CDC55	Q00362	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SKO1	Q02100	647 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DYN2	Q02647	92 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CSM3	Q04659	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	NSE1	Q07913	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YNG1	Q08465	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	BAG7	Q12128	409 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YOP1	Q12402	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	OCA6	Q12454	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AI1	P03875	834 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CLN3	P13365	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AFG1	P32317	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PTC1	P35182	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	UPS2	P35200	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SMF1	P38925	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	UBP5	P39944	805 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	GTT1	P40582	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	OPT1	P40897	799 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	IDP2	P41939	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PHO86	P46956	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ORC5	P50874	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	BUR2	Q05949	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	XYL2	Q07993	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	NRT1	Q08485	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CTI6	Q08923	506 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RCN2	Q12044	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AFI1	Q99222	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HTB2	P02294	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CLB2	P24869	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	NFS1	P25374	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PDR3	P33200	976 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
MSC7	YHR039C	UME6	P39001	836 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	POG1	P40473	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SER33	P40510	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	LSB6	P42951	607 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	FMP32	P43557	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YJL016W	P47072	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SBH2	P52871	88 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RSM27	P53305	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SPC98	P53540	846 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	AAT1	Q01802	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	EKI1	Q03764	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	GCR1	P07261	785 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	SEC65	P29478	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ISF1	P32488	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSC7	YHR039C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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