RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	RIP-Chip
MRP4	YHL004W	PDE2	P06776	526 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	GPA2	P10823	449 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	VMA16	P23968	213 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	BOS1	P25385	244 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PRE4	P30657	266 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PMT1	P33775	817 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	KKQ8	P36004	724 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MRPL37	P36532	105 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ECM13	P38195	257 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SPC97	P38863	823 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YJL070C	P40361	888 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	IME4	P41833	600 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RRT5	P43607	289 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	IDS2	P46958	469 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RTT101	P47050	842 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YGR149W	P48236	432 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YGR127W	P53275	312 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ECM18	Q04623	453 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PIG1	Q06216	648 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	BCP1	Q06338	283 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ARO10	Q06408	635 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	UBX3	Q12229	455 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	URA10	P30402	227 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	DEP1	P31385	405 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	NDI1	P32340	513 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	DOA4	P32571	926 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YME2	P32843	850 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
MRP4	YHL004W	PIM1	P36775	1133 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YBR056W	P38081	501 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SMF2	P38778	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SSO2	P39926	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YEL028W	P39989	153 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ALG5	P40350	334 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	BAP3	P41815	604 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MAF1	P41910	395 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YJL107C	P42947	387 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PET130	P47065	347 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	INN1	P53901	409 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SLT2	Q00772	484 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PNG1	Q02890	363 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	FAR8	Q05040	523 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MCM21	Q06675	368 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	AEP3	Q12089	606 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MED2	Q12124	431 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RBD2	Q12270	262 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MED4	Q12343	284 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ISN1	Q99312	450 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	HIP1	P06775	603 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ADY2	P25613	283 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	AFG1	P32317	509 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	EMP70	P32802	667 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MRPL4	P36517	319 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	ATG12	P38316	186 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YBR259W	P38338	688 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	STB5	P38699	743 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YJL206C	P39529	758 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YAT2	P40017	923 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	LRO1	P40345	661 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	INA17	Q02888	182 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RSM28	Q03430	361 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	SEG1	Q04279	960 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	MSC3	Q05812	728 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	COQ11	Q05892	277 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	YFH1	Q07540	174 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRP4	YHL004W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74

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