RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	YEH1	Q07804	573 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YLR302C	O13544	120 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	MRPL10	P36520	322 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	FRM2	P37261	193 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SDH4	P37298	181 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	RTC2	P38279	296 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	ERP2	P39704	215 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	ALG5	P40350	334 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TIM18	Q08749	192 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YPL199C	Q08954	240 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	ORT1	Q12375	292 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	AVL9	Q12500	764 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	MRE11	P32829	692 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	MRPL36	P36531	177 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	THI2	P38141	450 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YPS6	P40583	537 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YGL108C	P53139	140 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YRM1	Q12340	786 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YRF1-4	O13559	1382 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	PHO81	P17442	1178 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	MAL33	P38157	468 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	ICS2	P38284	255 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YHK8	P38776	514 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TIM17	P39515	158 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	LCL3	P53153	274 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YET2	Q04210	160 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	JID1	Q12350	301 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SPT7	P35177	1332 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	MHP1	P43638	1398 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	ATP10	P18496	279 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	CHS3	P29465	1165 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	GYP6	P32806	458 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YCR041W	P37265	110 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	PSY4	P38193	441 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SBE22	P38814	852 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	FHL1	P39521	936 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	PTR3	P43606	678 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YJL144W	P47009	104 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	MDE1	P47095	244 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	URB2	P47108	1174 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SSN8	P47821	323 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	GTR1	Q00582	310 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	RIP1	P08067	215 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SPO12	P17123	173 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SLY1	P22213	666 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SRB2	P34162	210 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	MET28	P40573	187 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	EGT2	P42835	1041 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	LAM5	P43560	674 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YGR021W	P53212	290 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YML037C	Q03703	340 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SRL2	Q12020	392 aa		0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	POL4	P25615	582 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	CDC50	P25656	391 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	FLC2	P39719	783 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SAP185	P40856	1058 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SAS2	P40963	338 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	VHT1	P53241	593 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	NRM1	P53718	249 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	FRE4	P53746	719 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	BCH1	Q05029	724 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	RIF2	Q06208	395 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YPR195C	Q06594	109 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	RAX1	Q08760	435 aa		0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MSI1	P13712	422 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SIN4	P32259	974 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	NIP100	P33420	868 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RRN3	P36070	627 aa		0.34	□□□□□ -2.36

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