RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W RKM5Q12367 367 aa2.91□□□□□ -1.94
RTT105YER104W GAL4P04386 881 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W IMA3P0CW40 589 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W IMA4P0CW41 589 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RPL12BP0CX54 165 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W HNM1P19807 563 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W HXT2P23585 541 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SLM5P25345 492 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YUH1P35127 236 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SPC34P36131 295 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YPK3P38070 525 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RIM2P38127 377 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ERG7P38604 731 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W STP2P38704 541 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W OSH3P38713 996 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YHR177WP38867 453 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RTS2P40962 232 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W HMS2P47175 358 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YPT11P48559 417 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YIP1P53039 248 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YGL114WP53134 725 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YGL082WP53155 381 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W PNG1Q02890 363 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RSC9Q03124 581 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W MMT1Q03218 510 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W MSS11Q03825 758 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W GRX3Q03835 250 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RNH1Q04740 348 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W THI20Q08224 551 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W IMA2Q08295 589 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YOR012WQ12351 137 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RMD5Q12508 421 aa2.9□□□□□ -1.95
RTT105YER104W AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W MSK1P32048 576 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W PDR3P33200 976 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SKN1P33336 771 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ECM15P35195 104 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YNK1P36010 153 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W PEX18P38855 283 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.89□□□□□ -1.95 RIP-Chip
RTT105YER104W ISC1P40015 477 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W MMF1P40185 145 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ATM1P40416 690 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W AIM20P40451 204 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SNL1P40548 159 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W CFD1P40558 293 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W NUP84P52891 726 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W PCP1P53259 346 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RET3P53600 189 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W STD1Q02794 444 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SPO19Q03029 223 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RRG8Q06109 277 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ECM7Q06200 448 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W NRT1Q08485 598 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YLR112WQ12130 139 aa2.89□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YAR066WP0CX18 203 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YHR214WP0CX19 203 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ARF1P11076 181 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W MSS116P15424 664 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W UGA1P17649 471 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SAR1P20606 190 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W MGR1P25573 417 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W EFB1P32471 206 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W FRE1P32791 686 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RSM22P36056 628 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YCR041WP37265 110 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SWC5P38326 303 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ALP1P38971 573 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W LOH1P47055 219 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W PMT5P52867 743 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W PNC1P53184 216 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W VOA1P53262 265 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RSN1Q03516 953 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W CAB5Q03941 241 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YMR087WQ04299 284 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ERV41Q04651 352 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W VPS74Q06385 345 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ARR1Q06596 294 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W VAC14Q06708 880 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SYO1Q07395 620 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W YDL009CQ12210 107 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W GLE1Q12315 538 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ORT1Q12375 292 aa2.88□□□□□ -1.95
RTT105YER104W STE2D6VTK4 431 aa2.87□□□□□ -1.95
RTT105YER104W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RTT105YER104W OPI3P05375 206 aa2.87□□□□□ -1.95
RTT105YER104W RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RTT105YER104W MAS2P11914 482 aa2.87□□□□□ -1.95
RTT105YER104W SEC62P21825 274 aa2.87□□□□□ -1.95
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