RNA–Protein interactions for RNA: YDL113C

ATG20, Transcript of Sorting nexin family member, yeast

Gene ATG20, Length 1,923 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG20	YDL113C	YEL020C	P39994	560 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	TOK1	P40310	691 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	RIC1	P40395	1056 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YFR018C	P43599	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	COS12	P53053	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	ZRG17	P53735	605 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YNL181W	P53878	407 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	IRC15	Q02733	499 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	EAR1	Q03212	550 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	ROT1	Q03691	256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	HED1	Q03937	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	SMP3	Q04174	516 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	ATG17	Q06410	417 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
ATG20	YDL113C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	GET4	Q12125	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	RAP1	P11938	827 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	RCK1	P38622	512 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	GIC1	P38785	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	QRI7	P43122	407 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YNR068C	P53754	272 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	GRS2	Q06817	618 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	MFG1	Q07684	458 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	RSA1	Q08932	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	ATG29	Q12092	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	CCH1	P50077	2039 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	HIS5	P07172	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	ALG7	P07286	448 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	HOG1	P32485	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	MEI5	P32489	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	BCK2	P33306	851 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	ECM4	P36156	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	ARA1	P38115	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	MET30	P39014	640 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	MSC1	Q03104	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	RAD30	Q04049	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	SWF1	Q04629	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	VPS74	Q06385	345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	NDL1	Q06568	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	THP1	Q08231	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	VCX1	Q99385	411 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	CBS2	P14905	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	GRR1	P24814	1151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	GSH1	P32477	678 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	SPO23	P33757	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	APT2	P36973	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	AVT6	P40074	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	SRB7	P47822	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	VPS68	Q12016	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	VIK1	Q12045	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	NMD4	Q12129	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	TYR1	P20049	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	NUP2	P32499	720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	RML2	P32611	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	LHS1	P36016	881 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YRO2	P38079	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	APQ12	P40532	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	BIR1	P47134	954 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	GAD1	Q04792	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	COS7	Q07788	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	PFA4	Q12006	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG20	YDL113C	MRP10	O75012	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG20	YDL113C	AI3	P03877	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG20	YDL113C	RED1	P14291	827 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG20	YDL113C	RER1	P25560	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG20	YDL113C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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