RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PAN6	P40459	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	QDR2	P40474	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	BIO3	P50277	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	BOL2	P53082	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YGR168C	P53293	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	NUP49	Q02199	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MEH1	Q02205	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RMI1	Q02685	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PIR1	Q03178	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	AIM36	Q03798	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PDR8	Q06149	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	OPT2	Q06593	877 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SWA2	Q06677	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MCD1	Q12158	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MDM32	Q12171	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MED4	Q12343	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PNS1	Q12412	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	AHC1	Q12433	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SUC2	P00724	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TRP3	P00937	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GCN4	P03069	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RAD7	P06779	565 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SWI5	P08153	709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ABF1	P14164	731 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	DAL81	P21657	970 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	CNB1	P25296	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	NTG1	P31378	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SCD5	P34758	872 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	JEN1	P36035	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	VPS51	P36116	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MRPL3	P36516	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	LDB7	P38210	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YBR184W	P38299	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PEX28	P38848	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	NDE1	P40215	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TED1	P40533	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MID1	P41821	548 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ALR2	P43553	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GYP8	P43570	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SIP4	P46954	829 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ECM27	P47144	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YJR120W	P47157	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	AIM14	P53109	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MRH4	P53166	561 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GTR2	P53290	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YAT1	P80235	687 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TRM82	Q03774	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RNH1	Q04740	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	BLS1	Q06071	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ASR1	Q06834	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	UPC2	Q12151	913 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	FAB1	P34756	2278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	CAN1	P04817	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ARG3	P05150	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	FPS1	P23900	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SGF29	P25554	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	EMC1	P25574	760 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MRPL9	P31334	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SYN8	P31377	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ZRT3	P34240	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PHO11	P35842	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MRPL17	P36528	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MCM7	P38132	845 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YBR137W	P38276	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PHO12	P38693	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	HEM14	P40012	539 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	COA1	P40452	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GTS1	P40956	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YFR018C	P43599	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YJR115W	P47152	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GPI8	P49018	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	NAS6	P50086	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	DAM1	P53267	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ARP4	P80428	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MAK3	Q03503	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.1 ms