RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	SCLY	Q96I15	445 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	LRCH3	Q96II8	777 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	PCYT2	Q99447	389 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	NFASC	O94856	1347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	SZT2	Q5T011	3432 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	CCNE2	O96020	404 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	FOSB	P53539	338 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	ACTR2	P61160	394 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	GALNT17	Q6IS24	598 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM199	Q8N511	208 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	TBCK	Q8TEA7	893 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	WNT8B	Q93098	351 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	SDF4	Q9BRK5	362 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	NOD1	Q9Y239	953 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	LGR5	O75473	907 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	MARK3	P27448	753 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXC8	P31273	242 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36	1e-6	■■■□□ 18.2
TPCN1-223	ENST00000552985	RABEP1	Q15276	862 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	INF2	Q27J81	1249 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM240	Q5SV17	173 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	WASF1	Q92558	559 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	GJA10	Q969M2	543 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36	2e-6	■□□□□ 8.7
TPCN1-223	ENST00000552985	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM205C	A6NFA0	338 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	PITPNM1	O00562	1244 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	TDP2	O95551	362 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	XBP1	P17861	261 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	USP11	P51784	963 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	NR5A1	Q13285	461 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF365	Q70YC5	407 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	GLG1	Q92896	1179 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	IL23A	Q9NPF7	189 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	SETD4	Q9NVD3	440 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	MSH4	O15457	936 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	TREH	O43280	583 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	ATG7	O95352	703 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	IQCF3	P0C7M6	154 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	ADAM17	P78536	824 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	PTK7	Q13308	1070 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	BFSP2	Q13515	415 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	SERINC5	Q86VE9	423 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	RETREG2	Q8NC44	543 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFRSF25	Q93038	417 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	MBOAT7	Q96N66	472 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	BACH2	Q9BYV9	841 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	EMSY	Q7Z589	1322 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC37A4	O43826	429 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	CKB	P12277	381 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	CYP3A7	P24462	503 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT2	P35908	639 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	GUCY1B3	Q02153	619 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	RBL2	Q08999	1139 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	GPNMB	Q14956	572 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985		Q4G0T1	1027 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT40	Q6A162	431 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	CAGE1	Q8TC20	777 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TPCN1-223	ENST00000552985	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37

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