RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	GPRASP2	Q96D09	838 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	ATP9A	O75110	1047 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	UPP2	O95045	317 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	NECTIN1	Q15223	517 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2S	Q16763	222 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TOP1MT	Q969P6	601 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	CDHR1	Q96JP9	859 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	NRCAM	Q92823	1304 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	KCNA2	P16389	499 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	ITGB5	P18084	799 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	FAM26D	Q5JW98	314 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	FANCB	Q8NB91	859 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	APBB2	Q92870	758 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	YME1L1	Q96TA2	773 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SAMD11	Q96NU1	681 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	CHRNA1	P02708	482 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	MTMR1	Q13613	665 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	EPC2	Q52LR7	807 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	MICU3	Q86XE3	530 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	JADE2	Q9NQC1	790 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	MAFG	O15525	162 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	MARK3	P27448	753 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PPFIA1	Q13136	1202 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	GRIK4	Q16099	956 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RPAIN	Q86UA6	219 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	GLG1	Q92896	1179 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DDX11-222	ENST00000542777	GHR	P10912	638 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	PTPRO	Q16827	1216 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	RSPH3	Q86UC2	560 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777		H3BNC9	293 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	MGAT3	Q09327	533 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	GPM6B	Q13491	265 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	RNF20	Q5VTR2	975 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM192	Q8IY95	271 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	NEK1	Q96PY6	1258 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	IGBP1	P78318	339 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	LPIN1	Q14693	890 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	APOA5	Q6Q788	366 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	IL17RA	Q96F46	866 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	KCNA5	P22460	613 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	NAPA	P54920	295 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	COL4A6	Q14031	1691 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	FIBCD1	Q8N539	461 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	PCYT2	Q99447	389 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	AZI2	Q9H6S1	392 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		18.35	■□□□□ 0.53

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