RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, human

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STIP1-208	ENST00000540501	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	28.91	■■■□□ 2.22	4e-8	■■■□□ 17
STIP1-208	ENST00000540501	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		28.91	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		28.91	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		28.91	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	ATG7	O95352	703 aa		28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	GJA9	P57773	515 aa		28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	NKX3-2	P78367	333 aa		28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	GJA10	Q969M2	543 aa		28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	UIMC1	Q96RL1	719 aa		28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	DISC1	Q9NRI5	854 aa		28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	SAMM50	Q9Y512	469 aa		28.9	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	ZEB2	O60315	1214 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	PPFIA4	O75335	1185 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	PSAP	P07602	524 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	TXLNA	P40222	546 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	ACTR2	P61160	394 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	IL17A	Q16552	155 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	KRT79	Q5XKE5	535 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	ZNF333	Q96JL9	665 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STIP1-208	ENST00000540501	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	KPNA6	O60684	536 aa		28.88	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	MUT	P22033	750 aa		28.88	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		28.88	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	GPR20	Q99678	358 aa		28.88	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		28.88	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		28.88	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	POTEM	A6NI47	508 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501		A6NJR5	290 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	ADCY6	O43306	1168 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CHMP2A	O43633	222 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CCL5	P13501	91 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	UBA7	P41226	1012 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	DGKD	Q16760	1214 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CSRNP2	Q9H175	543 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501		A0A1W2PQ27	194 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501		A0A1W2PQ64	194 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501		A0A1W2PQD8	194 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CCNE2	O96020	404 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	SP4	Q02446	784 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	RNF180	Q86T96	592 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	AFG1L	Q8WV93	481 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	RNF208	Q9H0X6	261 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	WDR81	Q562E7	1941 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CLIC6	Q96NY7	704 aa		28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	AZI2	Q9H6S1	392 aa		28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		28.85	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	EML1	O00423	815 aa		28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	MMP3	P08254	477 aa		28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CMA1	P23946	247 aa		28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	RPA1	P27694	616 aa		28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CALML4	Q96GE6	196 aa		28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		28.84	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	BACH1	O14867	736 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	SORBS3	O60504	671 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	LGR5	O75473	907 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	SLC26A2	P50443	739 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	GRIN1	Q05586	938 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	MTFR1	Q15390	333 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	LHX8	Q68G74	356 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	EMSY	Q7Z589	1322 aa		28.83	■■■□□ 2.21
STIP1-208	ENST00000540501	ADAMTS4	O75173	837 aa		28.82	■■■□□ 2.2
STIP1-208	ENST00000540501	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms