RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 ATP6V0A1Q93050 837 aa27.53■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 ZNF577Q9BSK1 485 aa27.53■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 WNT8AQ9H1J5 351 aa27.53■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 PKD2L1Q9P0L9 805 aa27.53■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 SELPP16109 830 aa27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 TRIM29Q14134 588 aa27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 ME3Q16798 604 aa27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 HERVK_113Q902F9 699 aa27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PITX3-202ENST00000539804 FAM86B1E9PN63 330 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 FAM86B2P0C5J1 330 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 IQCF3P0C7M6 154 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 ARP10275 920 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 HOXC8P31273 242 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 FAM160B1Q5W0V3 765 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 MOXD1Q6UVY6 613 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 BCAS3Q9H6U6 928 aa27.51■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 ST18O60284 1047 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 LGR5O75473 907 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 EPHB4P54760 987 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 ACTR2P61160 394 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 KRT76Q01546 638 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 RABEP1Q15276 862 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 ZNF365Q70YC5 407 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 LRRC8DQ7L1W4 858 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 SERINC5Q86VE9 423 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 PHF20Q9BVI0 1012 aa27.5■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 UMODL1Q5DID0 1318 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 RRN3P2A6NIE6 340 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 PRR16Q569H4 304 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 TAF2Q6P1X5 1199 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 RSPH3Q86UC2 560 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 TBCKQ8TEA7 893 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 RNPEPQ9H4A4 650 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 ATG7O95352 703 aa27.48■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 CKBP12277 381 aa27.48■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 STAT5BP51692 787 aa27.48■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 SCLYQ96I15 445 aa27.48■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 EFCAB14O75071 495 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 BAIAP3O94812 1187 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 ACRP10323 421 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 PPFIA1Q13136 1202 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 Q4G0T1 1027 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 C16orf59Q7L2K0 433 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 LRCH3Q96II8 777 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 RIT2Q99578 217 aa27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 M0R2N6 131 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 CYP3A7P24462 503 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 ZNF697Q5TEC3 545 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 RASIP1Q5U651 963 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 TRIM50Q86XT4 487 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 NECAB1Q8N987 351 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 PCDH10Q9P2E7 1040 aa27.46■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 DOCK5Q9H7D0 1870 aa27.45■■□□□ 1.99
PITX3-202ENST00000539804 BACH1O14867 736 aa27.45■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 CTDNEP1O95476 244 aa27.45■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 PSAPP07602 524 aa27.45■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 KRT2P35908 639 aa27.45■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa27.45■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.45■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa27.45■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 SFNP31947 248 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 THPOP40225 353 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 RAB30Q15771 203 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 DEFB128Q7Z7B8 93 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 LMBR1Q8WVP7 490 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 AIFM3Q96NN9 605 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 SETD4Q9NVD3 440 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 KCNJ14Q9UNX9 436 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 TRPC6Q9Y210 931 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 TANC1Q9C0D5 1861 aa27.43■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa27.43■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 WDR64B1ANS9 1081 aa27.43■■□□□ 1.98
PITX3-202ENST00000539804 RSPH10B2B2RC85 870 aa27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms