RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 NLRC5Q86WI3 1866 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 COL9A1P20849 921 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 CREB3L3Q68CJ9 461 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 LMBR1Q8WVP7 490 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 APBB2Q92870 758 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 TOP1MTQ969P6 601 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 OSBPL7Q9BZF2 842 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP9AO75110 1047 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 CTSHP09668 335 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNA2P16389 499 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 RXRAP19793 462 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 ARHGAP4P98171 946 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 SP4Q02446 784 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 RPAINQ86UA6 219 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 FBXO22Q8NEZ5 403 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 SAMD11Q96NU1 681 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 C17orf80Q9BSJ5 609 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC12A7Q9Y666 1083 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 MAFGO15525 162 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 ITGB5P18084 799 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 SGMS1Q86VZ5 419 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 FANCBQ8NB91 859 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 SEPT1Q8WYJ6 367 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 COL4A6Q14031 1691 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 SPDYE3A6NKU9 549 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 TAF2Q6P1X5 1199 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 TMTC3Q6ZXV5 915 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 JADE2Q9NQC1 790 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 PCDHA6Q9UN73 950 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 CHRNA1P02708 482 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 MTMR1Q13613 665 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 UBE2SQ16763 222 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 EPC2Q52LR7 807 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC82Q8N4S0 544 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 YME1L1Q96TA2 773 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC2Q9BYS8 371 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 EHMT1Q9H9B1 1298 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 ERAP1Q9NZ08 941 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4-210ENST00000489601 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 UPP2O95045 317 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 MGAT3Q09327 533 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 PPFIA1Q13136 1202 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 TEX2Q8IWB9 1127 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 ANO2Q9NQ90 1003 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 TTC3P53804 2025 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 MYO7AQ13402 2215 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 H3BNC9 293 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 GRIK4Q16099 956 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 PTPROQ16827 1216 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF20Q5VTR2 975 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 RUFY4Q6ZNE9 571 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 RSPH3Q86UC2 560 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 MICU3Q86XE3 530 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM192Q8IY95 271 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 GLG1Q92896 1179 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 MXRA8Q9BRK3 442 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 TUBE1Q9UJT0 475 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 GHRP10912 638 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 MARK3P27448 753 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 GPM6BQ13491 265 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 LPIN1Q14693 890 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 LEXMQ3ZCV2 418 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 WWC2Q6AWC2 1192 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 APOA5Q6Q788 366 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 DNAJB3Q8WWF6 145 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 IL17RAQ96F46 866 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 NEK1Q96PY6 1258 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 PCYT2Q99447 389 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 RIC8AQ9NPQ8 531 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 PKD2L1Q9P0L9 805 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 NFASCO94856 1347 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 FOSP01100 380 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-210ENST00000489601 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms