RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 UIMC1Q96RL1 719 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 CSF2RAP15509 400 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.42e-13■□□□□ 11.2
ACTB-211ENST00000480301 CCL23P55773 120 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 ACTR2P61160 394 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.43e-11■■■■■ 39.9
ACTB-211ENST00000480301 SHHQ15465 462 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 PCYT2Q99447 389 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 NOD1Q9Y239 953 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 ST18O60284 1047 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 LGR5O75473 907 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 ATG7O95352 703 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 CCNE2O96020 404 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 HOXC8P31273 242 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 IL27Q8NEV9 243 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 CYP3A7P24462 503 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 INF2Q27J81 1249 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 SCLYQ96I15 445 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 MSH4O15457 936 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 Q4G0T1 1027 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 KRT40Q6A162 431 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF25Q93038 417 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 MBOAT7Q96N66 472 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 EMSYQ7Z589 1322 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 PITPNM1O00562 1244 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 TDP2O95551 362 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 MMP1P03956 469 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 ACRP10323 421 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 KRT2P35908 639 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 NR5A1Q13285 461 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 PTK7Q13308 1070 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 BFSP2Q13515 415 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 GLG1Q92896 1179 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 VWCEQ96DN2 955 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.391e-27■■□□□ 12.9
ACTB-211ENST00000480301 IL23AQ9NPF7 189 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 SETD4Q9NVD3 440 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 FOSBP53539 338 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 RBL2Q08999 1139 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 TMEM240Q5SV17 173 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 RETREG2Q8NC44 543 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 CAGE1Q8TC20 777 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A5Q92911 643 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 WNT8BQ93098 351 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 TREHO43280 583 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 IQCF3P0C7M6 154 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 MARK3P27448 753 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 STAT5BP51692 787 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 ADAM17P78536 824 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 LETM2Q2VYF4 491 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 ZNF365Q70YC5 407 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 SERINC5Q86VE9 423 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 AZI2Q9H6S1 392 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 FAM205CA6NFA0 338 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 BTBD18B2RXH4 712 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 TRIM29Q14134 588 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 NEK8Q86SG6 692 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 GJA10Q969M2 543 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 TMX3Q96JJ7 454 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 RIT2Q99578 217 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 NRCAMQ92823 1304 aa23.73■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 GNAT1P11488 350 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 CKBP12277 381 aa23.72■■□□□ 1.39
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