RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 KLRF2D3W0D1 207 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 AMHP03971 560 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 GPM6BQ13491 265 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SEC23AQ15436 765 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 NEK9Q8TD19 979 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PHOX2BQ99453 314 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 IL25Q9H293 177 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SENP2Q9HC62 589 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SETD4Q9NVD3 440 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PTPRSQ13332 1948 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 POTEB3A0JP26 581 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 H3BNC9 293 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 H3BRB1 525 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB5O15062 677 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 IGHDP01880 384 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 CTSHP09668 335 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 HOXC8P31273 242 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SEMA3FQ13275 785 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 POTEBQ6S5H4 581 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM192Q8IY95 271 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 BANK1Q8NDB2 785 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PIGSQ96S52 555 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PRR33A8MZF0 331 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 CYTH3O43739 400 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 LGALS2P05162 132 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 TGFB3P10600 412 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 LTBRP36941 435 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 ADAM17P78536 824 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PADI6Q6TGC4 694 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 HOMER1Q86YM7 354 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SMC5Q8IY18 1101 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 SEPT8Q92599 483 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 UIMC1Q96RL1 719 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 EMSYQ7Z589 1322 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 GRM6O15303 877 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 CHRNA1P02708 482 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00271P0C7V0 271 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 POLR2MP0CAP2 368 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 CCND2P30279 289 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 ICAM3P32942 547 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 COL19A1Q14993 1142 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PTPROQ16827 1216 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 FAM26DQ5JW98 314 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM50Q86XT4 487 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 YME1L1Q96TA2 773 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 GPR20Q99678 358 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 KRT23Q9C075 422 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-208ENST00000479480 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-208ENST00000479480 ENPP3O14638 875 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-208ENST00000479480 ALADP13716 330 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-208ENST00000479480 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-208ENST00000479480 NT5C2P49902 561 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-208ENST00000479480 NUCB1Q02818 461 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-208ENST00000479480 ZP2Q05996 745 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-208ENST00000479480 GRM4Q14833 912 aa9.77□□□□□ -0.85
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