RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SDF4Q9BRK5 362 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XBP1P17861 261 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCYT2Q99447 389 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BACH2Q9BYV9 841 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SZT2Q5T011 3432 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCNE2O96020 404 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXC8P31273 242 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACTR2P61160 394 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM199Q8N511 208 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VWCEQ96DN2 955 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOD1Q9Y239 953 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT25Q7Z3Z0 450 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCLYQ96I15 445 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LGR5O75473 907 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATG7O95352 703 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WNT8BQ93098 351 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MSH4O15457 936 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TDP2O95551 362 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACRP10323 421 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYP3A7P24462 503 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOSBP53539 338 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 INF2Q27J81 1249 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PITPNM1O00562 1244 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MARK3P27448 753 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NR5A1Q13285 461 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q4G0T1 1027 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNFRSF25Q93038 417 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MBOAT7Q96N66 472 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IL23AQ9NPF7 189 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SETD4Q9NVD3 440 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EMSYQ7Z589 1322 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ST18O60284 1047 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTK7Q13308 1070 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM240Q5SV17 173 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT40Q6A162 431 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABHD15Q6UXT9 468 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLG1Q92896 1179 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D22BQ9NU19 505 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM205CA6NFA0 338 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TREHO43280 583 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MMP1P03956 469 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IQCF3P0C7M6 154 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT2P35908 639 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAM17P78536 824 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBL2Q08999 1139 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BFSP2Q13515 415 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERINC5Q86VE9 423 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAGE1Q8TC20 777 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GJA10Q969M2 543 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRCH3Q96II8 777 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MOXD1Q6UVY6 613 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF365Q70YC5 407 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RETREG2Q8NC44 543 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC5A5Q92911 643 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BTBD18B2RXH4 712 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CKBP12277 381 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AZI2Q9H6S1 392 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRCAMQ92823 1304 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC37A4O43826 429 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STAT5BP51692 787 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPNMBQ14956 572 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LETM2Q2VYF4 491 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEK8Q86SG6 692 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms