RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318121.7

CLSPN-202, Transcript of claspin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSPN, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPN-202ENST00000318121 MYL1P05976 194 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 AKR1A1P14550 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 RPA1P27694 616 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SP4Q02446 784 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 TNFAIP2Q03169 654 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 LENG9Q96B70 501 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 PANK2Q9BZ23 570 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 GJD2Q9UKL4 321 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 TRIM17Q9Y577 477 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 POTEMA6NI47 508 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 MSCO60682 206 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 HMGCRP04035 888 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CNGA1P29973 690 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 PSMC5P62195 406 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SPECC1Q5M775 1068 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SHC4Q6S5L8 630 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 TPH2Q8IWU9 490 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 WBP1LQ9NX94 342 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 KPNA6O60684 536 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SLFN14P0C7P3 912 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 USP6NLQ92738 828 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 GLG1Q92896 1179 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 WNT7AO00755 349 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SLC26A2P50443 739 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 PRKCZQ05513 592 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 EPSTI1Q96J88 318 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SPATA33Q96N06 139 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 UIMC1Q96RL1 719 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 RMND1Q9NWS8 449 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 Q9Y3F1 56 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 RARBP10826 455 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 KCNA2P16389 499 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 NDUFA8P51970 172 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 ACTR2P61160 394 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 LIG1P18858 919 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CYP2C19P33261 490 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CPT1AP50416 773 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SEMA3FQ13275 785 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF302Q9NR11 478 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 HPSEQ9Y251 543 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 PPME1Q9Y570 386 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 PLXNB2O15031 1838 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 PPFIA4O75335 1185 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 KIF20AO95235 890 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 PLCG1P19174 1290 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 GRK4P32298 578 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 STAT5BP51692 787 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CYP4A11Q02928 519 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SMARCE1Q969G3 411 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 DYDC2Q96IM9 177 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 DACH1Q9UI36 760 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 VAV3Q9UKW4 847 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSPN-202ENST00000318121 ATP9AO75110 1047 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms