RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zer1	Q80ZJ6	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cep85	Q8BMK0	761 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rasal3	Q8C2K5	1041 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plin1	Q8CGN5	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Armcx6	Q8K3A6	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn1r188	Q8K3N2	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Irf2bpl	Q8K3X4	775 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aagab	Q8R2R3	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mogat1	Q91ZV4	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ubxn1	Q922Y1	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyc1	Q9D0M3	325 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tacc3	Q9JJ11	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dgkd	E9PUQ8	1220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ces2g	E9PV38	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm7233	E9PZI8	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp266	E9Q2S7	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm9732	F6QVC4	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem132b	F7BAB2	1078 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm5798	F7BTS7	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tpte	G5E8H5	664 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm8011	K7N6Y5	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm8104	K7N744	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mknk1	O08605	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nmi	O35309	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kpna6	O35345	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Colq	O35348	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Jmjd7	P0C872	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Alox12	P39655	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sox18	P43680	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rps26	P62855	115 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sumo1	P63166	101 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mc1r	Q01727	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam198b	Q3UPI1	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gramd2a	Q3V3G7	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Birc2	Q62210	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cgnl1	Q6AW69	1298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdhb14	Q6PB90	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Uts2b	Q765I1	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ints2	Q80UK8	1198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fndc11	Q80WB0	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Coro2b	Q8BH44	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gabra5	Q8BHJ7	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc44a2	Q8BY89	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pias2	Q8C5D8	621 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Catsperz	Q9CQP8	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr73	Q9CWR1	371 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prame	Q9D4Z5	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pold3	Q9EQ28	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kdelc1	Q9JHP7	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nqo2	Q9JI75	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arhgef12	Q8R4H2	1543 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zscan18	E9PUD6	809 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm44503	E9PYU5	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	8030474K03Rik	E9Q4Y8	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm21969	J3QJZ1	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gsg1l2	M0QWL6	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ulk1	O70405	1051 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mbl2	P41317	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Epb42	P49222	691 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccna2	P51943	422 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcna7	Q17ST2	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Khsrp	Q3U0V1	748 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spc25	Q3UA16	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lin54	Q571G4	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Satb1	Q60611	764 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nfe2l2	Q60795	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cln3	Q61124	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arhgdib	Q61599	200 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kiaa0753	Q6A000	959 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kiaa1328	Q6NZK5	612 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clca4a	Q6Q473	924 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Elac2	Q80Y81	831 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc41a1	Q8BJA2	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zmym6	Q8BS54	1249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dis3l	Q8C0S1	1053 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam149a	Q8CFV2	787 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem60	Q8K174	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cplx3	Q8R1B5	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Iffo2	Q8R2V2	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnaaf4	Q8R368	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nrbf2	Q8VCQ3	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hyal3	Q8VEI3	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mat1a	Q91X83	396 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smc1b	Q920F6	1248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psat1	Q99K85	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Exosc5	Q9CRA8	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rsph14	Q9D3W1	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Actn2	Q9JI91	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptk2b	Q9QVP9	1009 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ulk2	Q9QY01	1037 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Polg2	Q9QZM2	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pmm2	Q9Z2M7	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mycs	Q9Z304	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Top2a	Q01320	1528 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankle1	A8VU90	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Unc13d	B2RUP2	1085 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il20rb	E9Q9A6	308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankrd35	E9Q9D8	996 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm5152	L7N200	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pdgfrb	P05622	1098 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.6 ms