Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B5

Cplx3, Complexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx3Q8R1B5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cplx3Q8R1B5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Cplx3Q8R1B5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cplx3Q8R1B5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Cplx3Q8R1B5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cplx3Q8R1B5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cplx3Q8R1B5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cplx3Q8R1B5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cplx3Q8R1B5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cplx3Q8R1B5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cplx3Q8R1B5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cplx3Q8R1B5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cplx3Q8R1B5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cplx3Q8R1B5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Cplx3Q8R1B5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cplx3Q8R1B5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Cplx3Q8R1B5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Cplx3Q8R1B5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cplx3Q8R1B5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cplx3Q8R1B5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cplx3Q8R1B5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cplx3Q8R1B5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Cplx3Q8R1B5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cplx3Q8R1B5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cplx3Q8R1B5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cplx3Q8R1B5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cplx3Q8R1B5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cplx3Q8R1B5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cplx3Q8R1B5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cplx3Q8R1B5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cplx3Q8R1B5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Cplx3Q8R1B5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cplx3Q8R1B5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cplx3Q8R1B5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cplx3Q8R1B5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Cplx3Q8R1B5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cplx3Q8R1B5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cplx3Q8R1B5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cplx3Q8R1B5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cplx3Q8R1B5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cplx3Q8R1B5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cplx3Q8R1B5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cplx3Q8R1B5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cplx3Q8R1B5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cplx3Q8R1B5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cplx3Q8R1B5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cplx3Q8R1B5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cplx3Q8R1B5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cplx3Q8R1B5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cplx3Q8R1B5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cplx3Q8R1B5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cplx3Q8R1B5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cplx3Q8R1B5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cplx3Q8R1B5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cplx3Q8R1B5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cplx3Q8R1B5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cplx3Q8R1B5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cplx3Q8R1B5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cplx3Q8R1B5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cplx3Q8R1B5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cplx3Q8R1B5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cplx3Q8R1B5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cplx3Q8R1B5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cplx3Q8R1B5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cplx3Q8R1B5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cplx3Q8R1B5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cplx3Q8R1B5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cplx3Q8R1B5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cplx3Q8R1B5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cplx3Q8R1B5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cplx3Q8R1B5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cplx3Q8R1B5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cplx3Q8R1B5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cplx3Q8R1B5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cplx3Q8R1B5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cplx3Q8R1B5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cplx3Q8R1B5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cplx3Q8R1B5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cplx3Q8R1B5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cplx3Q8R1B5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cplx3Q8R1B5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cplx3Q8R1B5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cplx3Q8R1B5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cplx3Q8R1B5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cplx3Q8R1B5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cplx3Q8R1B5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cplx3Q8R1B5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cplx3Q8R1B5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cplx3Q8R1B5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cplx3Q8R1B5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cplx3Q8R1B5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cplx3Q8R1B5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cplx3Q8R1B5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cplx3Q8R1B5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cplx3Q8R1B5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cplx3Q8R1B5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cplx3Q8R1B5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cplx3Q8R1B5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cplx3Q8R1B5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cplx3Q8R1B5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms