Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B5

Cplx3, Complexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx3Q8R1B5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Cplx3Q8R1B5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Cplx3Q8R1B5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Cplx3Q8R1B5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
Cplx3Q8R1B5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,88■■■□□ 2,85
Cplx3Q8R1B5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Cplx3Q8R1B5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Cplx3Q8R1B5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Cplx3Q8R1B5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Cplx3Q8R1B5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Cplx3Q8R1B5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Cplx3Q8R1B5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Cplx3Q8R1B5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Cplx3Q8R1B5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,61
Cplx3Q8R1B5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Cplx3Q8R1B5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Cplx3Q8R1B5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Cplx3Q8R1B5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cplx3Q8R1B5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Cplx3Q8R1B5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Cplx3Q8R1B5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Cplx3Q8R1B5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Cplx3Q8R1B5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Cplx3Q8R1B5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Cplx3Q8R1B5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Cplx3Q8R1B5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Cplx3Q8R1B5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Cplx3Q8R1B5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Cplx3Q8R1B5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cplx3Q8R1B5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cplx3Q8R1B5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,07■■■□□ 2,4
Cplx3Q8R1B5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cplx3Q8R1B5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Cplx3Q8R1B5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Cplx3Q8R1B5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Cplx3Q8R1B5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Cplx3Q8R1B5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Cplx3Q8R1B5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Cplx3Q8R1B5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cplx3Q8R1B5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cplx3Q8R1B5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Cplx3Q8R1B5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cplx3Q8R1B5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Cplx3Q8R1B5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Cplx3Q8R1B5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Cplx3Q8R1B5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cplx3Q8R1B5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Cplx3Q8R1B5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cplx3Q8R1B5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cplx3Q8R1B5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cplx3Q8R1B5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Cplx3Q8R1B5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cplx3Q8R1B5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Cplx3Q8R1B5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Cplx3Q8R1B5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cplx3Q8R1B5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cplx3Q8R1B5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cplx3Q8R1B5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cplx3Q8R1B5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cplx3Q8R1B5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cplx3Q8R1B5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cplx3Q8R1B5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cplx3Q8R1B5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cplx3Q8R1B5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cplx3Q8R1B5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cplx3Q8R1B5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Cplx3Q8R1B5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Cplx3Q8R1B5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Cplx3Q8R1B5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Cplx3Q8R1B5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Cplx3Q8R1B5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Cplx3Q8R1B5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cplx3Q8R1B5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cplx3Q8R1B5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cplx3Q8R1B5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cplx3Q8R1B5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cplx3Q8R1B5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cplx3Q8R1B5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cplx3Q8R1B5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cplx3Q8R1B5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cplx3Q8R1B5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cplx3Q8R1B5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cplx3Q8R1B5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cplx3Q8R1B5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cplx3Q8R1B5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cplx3Q8R1B5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cplx3Q8R1B5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cplx3Q8R1B5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cplx3Q8R1B5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cplx3Q8R1B5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2,07
Cplx3Q8R1B5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Cplx3Q8R1B5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cplx3Q8R1B5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cplx3Q8R1B5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cplx3Q8R1B5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cplx3Q8R1B5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Cplx3Q8R1B5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cplx3Q8R1B5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cplx3Q8R1B5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cplx3Q8R1B5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms