Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Zer1Q80ZJ6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Zer1Q80ZJ6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zer1Q80ZJ6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zer1Q80ZJ6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zer1Q80ZJ6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zer1Q80ZJ6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Zer1Q80ZJ6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Zer1Q80ZJ6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zer1Q80ZJ6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zer1Q80ZJ6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Zer1Q80ZJ6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zer1Q80ZJ6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zer1Q80ZJ6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Zer1Q80ZJ6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zer1Q80ZJ6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zer1Q80ZJ6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Zer1Q80ZJ6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zer1Q80ZJ6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zer1Q80ZJ6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zer1Q80ZJ6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zer1Q80ZJ6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zer1Q80ZJ6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zer1Q80ZJ6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zer1Q80ZJ6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zer1Q80ZJ6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zer1Q80ZJ6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Zer1Q80ZJ6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Zer1Q80ZJ6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zer1Q80ZJ6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zer1Q80ZJ6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zer1Q80ZJ6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zer1Q80ZJ6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zer1Q80ZJ6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zer1Q80ZJ6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zer1Q80ZJ6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zer1Q80ZJ6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zer1Q80ZJ6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zer1Q80ZJ6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zer1Q80ZJ6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zer1Q80ZJ6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Zer1Q80ZJ6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zer1Q80ZJ6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zer1Q80ZJ6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zer1Q80ZJ6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Zer1Q80ZJ6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zer1Q80ZJ6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zer1Q80ZJ6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zer1Q80ZJ6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zer1Q80ZJ6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zer1Q80ZJ6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zer1Q80ZJ6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zer1Q80ZJ6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zer1Q80ZJ6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zer1Q80ZJ6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zer1Q80ZJ6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zer1Q80ZJ6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zer1Q80ZJ6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Zer1Q80ZJ6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zer1Q80ZJ6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zer1Q80ZJ6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zer1Q80ZJ6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zer1Q80ZJ6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zer1Q80ZJ6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zer1Q80ZJ6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zer1Q80ZJ6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zer1Q80ZJ6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zer1Q80ZJ6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zer1Q80ZJ6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zer1Q80ZJ6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zer1Q80ZJ6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zer1Q80ZJ6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zer1Q80ZJ6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zer1Q80ZJ6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Zer1Q80ZJ6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zer1Q80ZJ6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zer1Q80ZJ6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zer1Q80ZJ6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zer1Q80ZJ6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zer1Q80ZJ6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zer1Q80ZJ6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zer1Q80ZJ6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zer1Q80ZJ6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zer1Q80ZJ6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zer1Q80ZJ6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zer1Q80ZJ6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zer1Q80ZJ6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zer1Q80ZJ6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zer1Q80ZJ6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zer1Q80ZJ6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zer1Q80ZJ6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zer1Q80ZJ6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zer1Q80ZJ6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zer1Q80ZJ6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zer1Q80ZJ6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zer1Q80ZJ6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zer1Q80ZJ6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zer1Q80ZJ6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zer1Q80ZJ6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zer1Q80ZJ6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms