Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccna2P51943 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccna2P51943 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccna2P51943 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccna2P51943 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccna2P51943 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccna2P51943 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccna2P51943 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccna2P51943 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccna2P51943 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccna2P51943 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccna2P51943 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccna2P51943 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccna2P51943 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccna2P51943 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccna2P51943 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccna2P51943 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccna2P51943 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccna2P51943 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccna2P51943 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccna2P51943 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccna2P51943 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccna2P51943 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccna2P51943 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccna2P51943 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccna2P51943 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccna2P51943 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccna2P51943 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccna2P51943 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccna2P51943 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccna2P51943 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccna2P51943 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccna2P51943 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccna2P51943 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccna2P51943 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccna2P51943 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccna2P51943 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccna2P51943 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccna2P51943 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccna2P51943 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccna2P51943 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccna2P51943 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccna2P51943 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccna2P51943 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccna2P51943 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccna2P51943 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccna2P51943 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccna2P51943 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccna2P51943 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccna2P51943 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccna2P51943 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccna2P51943 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccna2P51943 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccna2P51943 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccna2P51943 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccna2P51943 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccna2P51943 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccna2P51943 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccna2P51943 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccna2P51943 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccna2P51943 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccna2P51943 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccna2P51943 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccna2P51943 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccna2P51943 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccna2P51943 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccna2P51943 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccna2P51943 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccna2P51943 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccna2P51943 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccna2P51943 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccna2P51943 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccna2P51943 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccna2P51943 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccna2P51943 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccna2P51943 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccna2P51943 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccna2P51943 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccna2P51943 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccna2P51943 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccna2P51943 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccna2P51943 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccna2P51943 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccna2P51943 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccna2P51943 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccna2P51943 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccna2P51943 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccna2P51943 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccna2P51943 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccna2P51943 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccna2P51943 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccna2P51943 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccna2P51943 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccna2P51943 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccna2P51943 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccna2P51943 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccna2P51943 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccna2P51943 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccna2P51943 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccna2P51943 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms