RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	EMC1	P25574	760 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PGS1	P25578	521 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	UBC8	P28263	218 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SYN8	P31377	255 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SSH4	P32343	579 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PUP2	P32379	260 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MTC7	P32633	139 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	TFB1	P32776	642 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NPL6	P32832	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SEC66	P33754	206 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CTF13	P35203	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	FRE2	P36033	711 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YKR015C	P36111	568 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CAF4	P36130	643 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	LDB7	P38210	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YBR138C	P38277	524 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YBR285W	P38354	144 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YHR218W	P38899	603 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
TRS33	YOR115C	YRB2	P40517	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YIR016W	P40572	265 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MAD2	P40958	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	KEL2	P50090	882 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	EXG2	P52911	562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YNL143C	P53908	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NSE5	Q03718	556 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RAD30	Q04049	632 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MCP2	Q06567	569 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PSR1	Q07800	427 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	VCX1	Q99385	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YLR415C	O13578	112 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SED4	P25365	1065 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	POL4	P25615	582 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NTG1	P31378	399 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PET127	P32606	800 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	COX13	P32799	129 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	LHS1	P36016	881 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	APM3	P38153	483 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YHR045W	P38775	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MTW1	P39731	289 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PZF1	P39933	429 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	AVT6	P40074	448 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YJL070C	P40361	888 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RIC1	P40395	1056 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	AGP3	P43548	558 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	VAC7	P53950	1165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SPR6	Q01684	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	BSP1	Q06604	576 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	GPI11	Q06636	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MCM21	Q06675	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
TRS33	YOR115C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	DIN7	Q12086	430 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PEX11	Q12462	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	TIM9	O74700	87 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CDC21	P06785	304 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SPT3	P06844	337 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CBS2	P14905	389 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PEX1	P24004	1043 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	OCA4	P25366	362 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PEX3	P28795	441 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SDH3	P33421	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SDS22	P36047	338 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MRPL40	P36534	297 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YBR241C	P38142	488 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MSS4	P38994	779 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	AIM20	P40451	204 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
TRS33	YOR115C	BUD8	P41698	603 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MEP2	P41948	499 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	STB2	P46679	850 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PET130	P47065	347 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NAS6	P50086	228 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MNT2	P53059	558 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SHY1	P53266	389 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	FRE4	P53746	719 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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