RNA–Protein interactions for RNA: YMR309C

NIP1, Transcript of eIF3c subunit of the eukaryotic translation initiation factor 3 (eIF3), yeast

Gene NIP1, Length 2,439 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NIP1	YMR309C	CYC3	P06182	269 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PPH22	P23595	377 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	OCA4	P25366	362 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PRR1	P28708	518 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	NIP100	P33420	868 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PMT1	P33775	817 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SPT10	P35208	640 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	CMC1	P36064	111 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MUM2	P38236	366 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RTC2	P38279	296 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SSU1	P41930	458 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	HXT14	P42833	540 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YNR048W	P53740	393 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	KTR6	P54070	446 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SLG1	P54867	378 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	GIP3	Q03016	1276 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	FDH1	Q08911	376 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RIM20	Q12033	661 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ATG29	Q12092	213 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	JID1	Q12350	301 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PRM7	Q12459	698 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PRB1	P09232	635 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	HOM3	P10869	527 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SPO12	P17123	173 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	GPI10	P30777	616 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	HIR2	P32480	875 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YBR056W	P38081	501 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YBR137W	P38276	179 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	COX14	P39103	70 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	OXA1	P39952	402 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YER184C	P39961	794 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YER186C	P40101	306 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SEC9	P40357	651 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	HAC1	P41546	238 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	VPS75	P53853	264 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MRPS16	Q02608	121 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	OAZ1	Q02803	292 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	AIM32	Q04689	311 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SIL1	Q08199	421 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PLP2	Q12017	286 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YPS3	Q12303	508 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	COX4	P04037	155 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MET8	P15807	274 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ITR1	P30605	584 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	GPI18	P38211	433 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SEO1	P39709	593 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MAM33	P40513	266 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
NIP1	YMR309C	FLC3	P53121	802 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YKU80	Q04437	629 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RIF2	Q06208	395 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YDR056C	Q12025	205 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ORT1	Q12375	292 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MSI1	P13712	422 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	KAR9	P32526	644 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	TFB1	P32776	642 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	FMT1	P32785	401 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	COX13	P32799	129 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YEL057C	P39983	233 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MET28	P40573	187 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SAS2	P40963	338 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YFL012W	P43580	148 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SFH5	P47008	294 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	FMS1	P50264	508 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YGL262W	P53054	175 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	YIP5	P53108	310 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	MRM2	P53123	320 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	BCH1	Q05029	724 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	HSP42	Q12329	375 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	EAF3	Q12432	401 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	AHC1	Q12433	566 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	ARG3	P05150	338 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	BEM1	P29366	551 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	VID27	P40157	782 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	JLP2	P40206	208 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	SPO22	P40511	975 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	CHS6	P40955	746 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NIP1	YMR309C	AIM24	P47127	394 aa		0.44	□□□□□ -2.34

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