RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	SSH4	P32343	579 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	PPG1	P32838	368 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	FTH1	P38310	465 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	AVT6	P40074	448 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	EMP65	P40085	556 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	CDC1	P40986	491 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	FLC3	P53121	802 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	MUK1	Q02866	612 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	SYO1	Q07395	620 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	YDL114W	Q07530	308 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	RAX1	Q08760	435 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	YOR342C	Q12182	319 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	AI3	P03877	415 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	SPS4	P09937	338 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	YCR099C	P25657	155 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	BIO2	P32451	375 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	PMT1	P33775	817 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	LST4	P34239	828 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	RIM2	P38127	377 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	PHM8	P40025	321 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	BUR6	P40096	142 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	PHB2	P50085	310 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	MPS2	P53159	387 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	HOL1	P53389	586 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	NSG2	P53898	299 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	ARP4	P80428	489 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	SLT2	Q00772	484 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	XYL2	Q07993	356 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	YNG1	Q08465	219 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RRP5	YMR229C	TOP3	P13099	656 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CDC23	P16522	626 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PTP1	P25044	335 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	STE5	P32917	917 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SDH3	P33421	198 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YPK3	P38070	525 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PZF1	P39933	429 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YEL020C	P39994	560 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ATM1	P40416	690 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SSN8	P47821	323 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ARK1	P53974	638 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RAD30	Q04049	632 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SPO77	Q06134	477 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RTT10	Q08924	1013 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YOS9	Q99220	542 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	UNG1	P12887	359 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YBL010C	P32788	280 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YSC84	P32793	468 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YBR242W	P38331	238 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	LAS21	P40367	830 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PAN6	P40459	309 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MTC3	P53077	123 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MNT4	P53745	580 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YML131W	Q03102	365 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	NMD4	Q12129	218 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	STE7	P06784	515 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CDC4	P07834	779 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	HAP4	P14064	554 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
RRP5	YMR229C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	BMT2	P38278	337 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YHR112C	P38716	378 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ZRG8	P40021	1076 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	FCY21	P40039	528 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RRT5	P43607	289 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PHO86	P46956	311 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	DIC1	Q06143	298 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	GSH2	Q08220	491 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	NDJ1	Q12366	352 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SUC2	P00724	532 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SEC61	P32915	480 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RIB5	P38145	238 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ALG3	P38179	458 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CTF8	P38877	133 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CCT6	P39079	546 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MNN1	P39106	762 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	TIR3	P40552	269 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	BUD17	P53727	317 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	COS1	P53822	381 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	NIS1	P53939	407 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	TSA2	Q04120	196 aa		3.21	□□□□□ -1.9

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