RNA–Protein interactions for RNA: YML121W

GTR1, Transcript of Cytoplasmic GTPase, yeast

Gene GTR1, Length 933 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR1	YML121W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	END3	P39013	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PAC11	P40960	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YHC3	P47040	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	STD1	Q02794	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PIG1	Q06216	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RUP1	Q12242	671 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	UGA1	P17649	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SEC62	P21825	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SWC5	P38326	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	ERG7	P38604	731 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	INM1	P38710	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	CTM1	P38818	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	BZZ1	P38822	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PEX18	P38855	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	IAH1	P41734	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YJR154W	P47181	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	LSB1	P53281	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	ARV1	Q06541	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PEX27	Q08580	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SUC2	P00724	532 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	CDC21	P06785	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	UNG1	P12887	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	GSY2	P27472	705 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	TPO5	P36029	618 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YKL070W	P36087	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	LAG1	P38703	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	ARN1	P38731	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YHR177W	P38867	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YPS6	P40583	537 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YGL114W	P53134	725 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SPO19	Q03029	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RSC9	Q03124	581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	CAB5	Q03941	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	CHS1	P08004	1131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	HNM1	P19807	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	GID7	P25569	745 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	COT1	P32798	439 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RGT1	P32862	1170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	CBP4	P37267	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	STV1	P37296	890 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	STP2	P38704	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	ALP1	P38971	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	HXT9	P40885	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	GTO1	P48239	356 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SCS3	P53012	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PKP2	P53170	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RTT102	P53330	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YNL146W	P53906	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	CSI1	Q04368	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RDR1	Q08904	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	MAS1	P10507	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	BAR1	P12630	587 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	PET123	P17558	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RPB8	P20436	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	HXT2	P23585	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	NTG1	P31378	399 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	HMX1	P32339	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RAD24	P32641	659 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	MRP4	P32902	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	APD1	P38281	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RTT107	P38850	1070 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SPG5	P42933	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	TRS85	P46944	698 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	UBP8	P50102	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YGL242C	P53066	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YGL185C	P53100	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	MND1	P53102	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SOL4	P53315	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	DSL1	P53847	754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	ERV41	Q04651	352 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	VAC14	Q06708	880 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	RMD5	Q12508	421 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GTR1	YML121W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22 ms