RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	KRE2	P27809	442 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	BEM1	P29366	551 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	NPL6	P32832	435 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	NFU1	P32860	256 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	KKQ8	P36004	724 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	COS5	P47187	383 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SRB7	P47822	140 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YGL138C	P53122	345 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	MDM30	Q05930	598 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	COS7	Q07788	383 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SCM3	Q12334	223 aa		2.58	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	TRP1	P00912	224 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RHB1	P25378	209 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YME2	P32843	850 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	JNM1	P36224	373 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YBR137W	P38276	179 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	PAN6	P40459	309 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	MDG1	P53885	366 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YMR155W	Q03795	547 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	ORT1	Q12375	292 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YRF1-4	O13559	1382 aa		2.57	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	REC107	P21651	314 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SNT1	P25357	1226 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	HIR2	P32480	875 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	MNS1	P32906	549 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	MSG5	P38590	489 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	MTM1	P53320	366 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RSN1	Q03516	953 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	BET5	Q03630	159 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	MHR1	Q06630	226 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RBD2	Q12270	262 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RMD5	Q12508	421 aa		2.56	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SCEI	P03882	235 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SPO7	P18410	259 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	CTR86	P25355	563 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YCR051W	P25631	222 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SPR1	P32603	445 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SSU1	P41930	458 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	KAP120	Q02932	1032 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	PEX25	Q02969	394 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	DON1	Q05610	365 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SOR2	Q07786	357 aa		2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	NFT1	P0CE68	1218 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	GEX1	P25596	615 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	POP5	P28005	173 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	BYE1	P36106	594 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	MMS4	P38257	691 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	RRT2	P38332	387 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YAL037W	P39728	267 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	TIS11	P47977	285 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	AZR1	P50080	613 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	PHB2	P50085	310 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	GPI15	P53961	229 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SKO1	Q02100	647 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	GIP3	Q03016	1276 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	TAF12	Q03761	539 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	ROY1	Q04847	553 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	ISN1	Q99312	450 aa		2.54	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	CYC3	P06182	269 aa		2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	SPO12	P17123	173 aa		2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	CLN1	P20437	546 aa		2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	PHO86	P46956	311 aa		2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	YLR152C	P54072	576 aa		2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	FDH1	Q08911	376 aa		2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	AFI1	Q99222	893 aa		2.53	□□□□□ -2
CSE4	YKL049C	URA4	P20051	364 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	RAD57	P25301	460 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	HXT1	P32465	570 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	KAR9	P32526	644 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	RRN10	P38204	145 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	JLP2	P40206	208 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	SHY1	P53266	389 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	OAZ1	Q02803	292 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	YMR130W	Q04223	302 aa		2.52	□□□□□ -2.01

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