RNA–Protein interactions for RNA: YJL178C

ATG27, Transcript of Type I membrane protein involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG27, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG27	YJL178C	TCB2	P48231	1178 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG27	YJL178C	COS10	P52924	374 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG27	YJL178C	RET3	P53600	189 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG27	YJL178C	FIN1	Q03898	291 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG27	YJL178C	IVY1	Q04934	453 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG27	YJL178C	BNA5	Q05979	453 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG27	YJL178C	YDL009C	Q12210	107 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG27	YJL178C	CEX1	Q12453	761 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG27	YJL178C	SET6	Q12529	373 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG27	YJL178C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	GPI10	P30777	616 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	MRE11	P32829	692 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	CAB3	P36076	571 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YBP1	P38315	674 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	CTM1	P38818	585 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SHC1	P39000	512 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	MBB1	P39534	108 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RPR2	P40571	144 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YJL132W	P47014	750 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	COG4	Q06096	861 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	TLG2	Q08144	397 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	AYT1	Q12226	474 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RKM5	Q12367	367 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	UTR4	P32626	227 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	PMT1	P33775	817 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	MUM2	P38236	366 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	VPS45	P38932	577 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RTC4	P53850	401 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SFI1	Q12369	946 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	ATR1	P13090	542 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	CBS2	P14905	389 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RAD57	P25301	460 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	AGA1	P32323	725 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	ATP11	P32453	318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	MET18	P40469	1032 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	EFM4	P40516	257 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	VTC2	P43585	828 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	TOS3	P43637	560 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	FMS1	P50264	508 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YGR117C	P53270	476 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	BOR1	P53838	576 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	PGA2	P53903	129 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	VPS74	Q06385	345 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	HEM2	P05373	342 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	OM45	P16547	393 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	EXO70	P19658	623 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YOX1	P34161	385 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SAS3	P34218	831 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	PMU1	P36069	295 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YBR139W	P38109	508 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	VID24	P38263	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SIP3	P38717	1229 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SMF1	P38925	575 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	ERP2	P39704	215 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
ATG27	YJL178C	IRC6	P43615	237 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	TWF1	P53250	332 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	GPI1	P53306	609 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	MRPL19	P53875	158 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	ALF1	P53904	254 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	ARK1	P53974	638 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SLG1	P54867	378 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	CSM3	Q04659	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YDR278C	Q05612	105 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YLR287C	Q05881	355 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	YLH47	Q06493	454 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SIL1	Q08199	421 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	ATG29	Q12092	213 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SEC39	Q12745	709 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	SMC6	Q12749	1114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	CKA1	P15790	372 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	CKA2	P19454	339 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG27	YJL178C	LTV1	P34078	463 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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