RNA–Protein interactions for RNA: YHR104W

GRE3, Transcript of Aldose reductase, yeast

Gene GRE3, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRE3	YHR104W	LEU5	P38702	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	CSM2	P40465	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RTT102	P53330	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YNL181W	P53878	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SLD5	Q03406	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	BUB3	P26449	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	PSO2	P30620	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YPK3	P38070	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YAL037W	P39728	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YFR018C	P43599	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YPT11	P48559	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RPN14	P53196	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YLH47	Q06493	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	PEX27	Q08580	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	ATG34	Q12292	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	GAL4	P04386	881 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	DST1	P07273	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	CHS1	P08004	1131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	HMX1	P32339	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	ERG7	P38604	731 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RTT107	P38850	1070 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	CFD1	P40558	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
GRE3	YHR104W	SAM50	P53969	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	MMT1	Q03218	510 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	URH1	Q04179	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	VPS63	O13549	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	MAS1	P10507	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	PDR3	P33200	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	PPZ2	P33329	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RSM22	P36056	628 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RIM2	P38127	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RTS2	P40962	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YHC3	P47040	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	HMS2	P47175	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	PCP1	P53259	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	GPI15	P53961	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	PNG1	Q02890	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	MSS11	Q03825	758 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	THI20	Q08224	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SGT1	Q08446	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	NRT1	Q08485	598 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	CTR86	P25355	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	MGR1	P25573	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	PPZ1	P26570	692 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RGT1	P32862	1170 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	MIC60	P36112	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SPC34	P36131	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SCO2	P38072	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	END3	P39013	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YNL146W	P53906	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	NUP53	Q03790	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	BNA5	Q05979	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	OSW1	Q08692	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	FRE7	Q12333	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RKM5	Q12367	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	GAL3	P13045	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	ECM15	P35195	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	SPT8	P38915	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
GRE3	YHR104W	SNL1	P40548	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	YIP1	P53039	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	YGL114W	P53134	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	RSC9	Q03124	581 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	URC2	Q04411	772 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	VPS74	Q06385	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	CUR1	Q06469	252 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	GLE1	Q12315	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRE3	YHR104W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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