RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	YFL054C	P43549	646 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RPE1	P46969	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YDL186W	P48568	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	THI13	Q07748	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RRT12	P25381	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	STP22	P25604	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ACB1	P31787	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MSK1	P32048	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CHK1	P38147	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HXT9	P40885	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	IRC8	P47046	822 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YJR115W	P47152	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YJR154W	P47181	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SGF73	P53165	657 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SUL2	Q12325	893 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CAN1	P04817	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RAD57	P25301	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YIM1	P28625	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ALP1	P38971	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CTH1	P47976	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YDR366C	P87287	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	URH1	Q04179	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CSC1	Q06538	782 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SRD1	P09007	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	FRE1	P32791	686 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PGD1	P40356	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GON7	P46984	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	UBX3	Q12229	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	URA6	P15700	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	DAL81	P21657	970 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SMF1	P38925	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SLZ1	P40167	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	IRC7	P43623	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MRK1	P50873	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MED7	Q08278	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GCR1	P07261	785 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	REV1	P12689	985 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RGI2	P40188	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	IML1	P47170	1584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HHT1	P61830	136 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HOS1	Q12214	470 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SAL1	D6W196	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AHC2	P25649	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ERG7	P38604	731 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TGL3	P40308	642 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YJL045W	P47052	634 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RSM27	P53305	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SHR3	Q02774	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RSM24	Q03976	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PAM18	Q07914	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	FCY22	Q12119	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	ERV2	Q12284	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TSC13	Q99190	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	VHC1	P38329	1120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	RTA1	P53047	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	SMA1	Q02651	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PEX10	Q05568	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	CCA1	P21269	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PTC1	P35182	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YKR075C	P36155	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	AIM18	P38884	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	DUN1	P39009	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	PHB2	P50085	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	NIS1	P53939	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	HXT11	P54862	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	FRE3	Q08905	711 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	VCX1	Q99385	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BLM10	YFL007W	GAL7	P08431	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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