RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	MRPL37	P36532	105 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PPS1	P38148	807 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ATM1	P40416	690 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YJL163C	P46996	555 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ECL1	P48235	211 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	KEL2	P50090	882 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ROG1	P53118	685 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	NUP53	Q03790	475 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	APC4	Q04601	652 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	COX20	Q04935	205 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	DCS1	Q06151	350 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	CTS2	Q06350	511 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MDM36	Q06820	579 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SOR2	Q07786	357 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RAX1	Q08760	435 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RAD61	Q99359	647 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	COR1	P07256	457 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PDE1	P22434	369 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YPS1	P32329	569 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ANS1	P38832	159 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	TRS85	P46944	698 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YGR126W	P53274	230 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RSM24	Q03976	319 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	CSI1	Q04368	295 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	NSE1	Q07913	336 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YPL229W	Q99395	206 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YPR089W	O13585	888 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SEC12	P11655	471 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YPK2	P18961	677 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	UTR1	P21373	530 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MEI5	P32489	222 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ELM1	P32801	640 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RGT1	P32862	1170 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	AIM29	P36154	155 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PHO90	P39535	881 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YMR134W	P40207	237 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	FAR3	P46671	204 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YIP4	P53093	235 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YGL117W	P53133	265 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RIM8	P53179	542 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YGR127W	P53275	312 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YMR130W	Q04223	302 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ASR1	Q06834	288 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	TEN1	Q07921	160 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RAD1	P06777	1100 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	GPA1	P08539	472 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RHB1	P25378	209 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	GID7	P25569	745 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	VAM7	P32912	316 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	MRPL10	P36520	322 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YHR045W	P38775	560 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PLB1	P39105	664 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RCY1	P39531	840 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YAL037W	P39728	267 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	BUR6	P40096	142 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SNO2	P53823	222 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.68	□□□□□ -1.98	not detected
AI2	Q0055	SED5	Q01590	340 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PET117	Q02771	107 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YDR541C	Q03049	344 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	NRG1	Q03125	231 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	IZH1	Q03419	316 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	FUS2	Q05670	677 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	BNA5	Q05979	453 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	IMA3	P0CW40	589 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	IMA4	P0CW41	589 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	CLN3	P13365	580 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PRE8	P23639	250 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	VPS3	P23643	1011 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	LAC1	P28496	418 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	BEM1	P29366	551 aa		2.68	□□□□□ -1.98

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