RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 STOX1Q6ZVD7 989 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 FCHSD1Q86WN1 690 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM50BQ9Y247 325 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BNC9 293 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS2P05162 132 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TGFB3P10600 412 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 GHRHRQ02643 423 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM192Q8IY95 271 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NEK9Q8TD19 979 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2MP0CAP2 368 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TOP1MTQ969P6 601 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 CNNM2Q9H8M5 875 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 DCXO43602 365 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD3Q8N6K7 520 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 RNPEPQ9H4A4 650 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDND1Q9NY35 253 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 CAND2O75155 1236 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 GNAT1P11488 350 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 GNPTABQ3T906 1256 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 DSCC1Q9BVC3 393 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 CTNNB1P35222 781 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAF1Q13077 416 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR8Q96EF0 704 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBPL7Q9BZF2 842 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 BCAS3Q9H6U6 928 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 SETD4Q9NVD3 440 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 MAD2L2Q9UI95 211 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC6Q6W4X9 2439 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 HIP1O00291 1037 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXC8P31273 242 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 APBB2Q92870 758 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGSQ96S52 555 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CYFIP1Q7L576 1253 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 FIBCD1Q8N539 461 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 IL17RAQ96F46 866 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 USP26Q9BXU7 913 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMA4Q16363 1823 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP4P98171 946 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 SP4Q02446 784 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ZP2Q05996 745 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 NEDD9Q14511 834 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 RPAINQ86UA6 219 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM50Q86XT4 487 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 MICAL3Q7RTP6 2002 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL7BQ6UX53 244 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKAG3Q9UGI9 489 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH6P13533 1939 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CSPG5O95196 566 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC23AQ15436 765 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CLUL1Q15846 466 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 RTEL1Q9NZ71 1219 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH7BA7E2Y1 1941 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB5R4Q7L1T6 521 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ADHFE1Q8IWW8 467 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR20Q99678 358 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PIEZO1Q92508 2521 aa31.64■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 NCK2O43639 380 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 TRDNQ13061 729 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 GRM4Q14833 912 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 CHD1LQ86WJ1 897 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 LMBR1Q8WVP7 490 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 PIBF1Q8WXW3 757 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 FIBPO43427 364 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 STAM2O75886 525 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 GHRP10912 638 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35G1Q2M3R5 365 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 ICAM3P32942 547 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBPL3Q9H4L5 887 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 RIOX1Q9H6W3 641 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 RWDD3Q9Y3V2 267 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 COL4A6Q14031 1691 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEB3A0JP26 581 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 ERICH2A1L162 156 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 RB1P06400 928 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 MRE11P49959 708 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA3FQ13275 785 aa31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 185.9 ms