RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587634.5

NEDD4L-219, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 628 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-219	ENST00000587634	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	ADAM17	P78536	824 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	ADGRE1	Q14246	886 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	NTRK3	Q16288	839 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	METTL7B	Q6UX53	244 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	SPRED2	Q7Z698	418 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	FBXL16	Q8N461	479 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	BRF1	Q92994	677 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	USP26	Q9BXU7	913 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NEDD4L-219	ENST00000587634	NID2	Q14112	1375 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634		H3BRB1	525 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	STAM2	O75886	525 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	RPS6KB1	P23443	525 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	KRT32	Q14532	448 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	USP38	Q8NB14	1042 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	PCYT2	Q99447	389 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	TRANK1	O15050	2925 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	TREH	O43280	583 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	CXCL10	P02778	98 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	AR	P10275	920 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SELP	P16109	830 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	EVC	P57679	992 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SP4	Q02446	784 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SERINC5	Q86VE9	423 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	C7orf31	Q8N865	590 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	CUL5	Q93034	780 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	BARHL2	Q9NY43	387 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	EPOP	A6NHQ4	379 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	DTNB	O60941	627 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	RCAN1	P53805	252 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	NAPA	P54920	295 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	DEFB103A	P81534	67 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	PTK7	Q13308	1070 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	BFSP2	Q13515	415 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	NEDD9	Q14511	834 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	CAGE1	Q8TC20	777 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	PHKB	Q93100	1093 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	GPRASP2	Q96D09	838 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	JADE2	Q9NQC1	790 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SETD4	Q9NVD3	440 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SMCO2	A6NFE2	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	PFKM	P08237	780 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	RFC2	P35250	354 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	RETREG2	Q8NC44	543 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	NOD1	Q9Y239	953 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	LCHN	A4D1U4	455 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	ZBBX	A8MT70	800 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	FAM86B1	E9PN63	330 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-219	ENST00000587634	MEIS1	O00470	390 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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