RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.57■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 USP26Q9BXU7 913 aa29.57■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 CYTH3O43739 400 aa29.56■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 GNAT1P11488 350 aa29.56■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 PTH1RQ03431 593 aa29.56■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 FBXO22Q8NEZ5 403 aa29.56■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa29.56■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 SEPT8Q92599 483 aa29.56■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 CUL5Q93034 780 aa29.56■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 SENP2Q9HC62 589 aa29.56■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 E7EWF7 191 aa29.55■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 TROAPQ12815 778 aa29.55■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 METTL7BQ6UX53 244 aa29.55■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 CYFIP1Q7L576 1253 aa29.55■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 RTEL1Q9NZ71 1219 aa29.55■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 XIRP2A4UGR9 3374 aa29.55■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 TREHO43280 583 aa29.54■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 FIBPO43427 364 aa29.54■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 CTSHP09668 335 aa29.54■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa29.54■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 RNPEPQ9H4A4 650 aa29.54■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 SIP14410 1827 aa29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 CAND2O75155 1236 aa29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 CHMLP26374 656 aa29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 PDE4AP27815 886 aa29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 ICAM3P32942 547 aa29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 YME1L1Q96TA2 773 aa29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 C17orf80Q9BSJ5 609 aa29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 BCAS3Q9H6U6 928 aa29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa29.52■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 SP4Q02446 784 aa29.52■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 SETD4Q9NVD3 440 aa29.52■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 FRMPD4Q14CM0 1322 aa29.51■■■□□ 2.32
E2F4-213ENST00000569573 BDP1A6H8Y1 2624 aa29.51■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa29.51■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 UPP2O95045 317 aa29.51■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 HOXC8P31273 242 aa29.51■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 KIF5BP33176 963 aa29.51■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 GPR20Q99678 358 aa29.51■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 PTPROQ16827 1216 aa29.5■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 NLRX1Q86UT6 975 aa29.5■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 SAMD11Q96NU1 681 aa29.5■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 EPHX3Q9H6B9 360 aa29.5■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 MICAL3Q7RTP6 2002 aa29.5■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 ARHGAP4P98171 946 aa29.49■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 CASC1Q6TDU7 716 aa29.49■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 TRIM50Q86XT4 487 aa29.49■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 FAM122AQ96E09 287 aa29.49■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.49■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 DDAH1O94760 285 aa29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 KCNA5P22460 613 aa29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 PCNX4Q63HM2 1172 aa29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 XRRA1Q6P2D8 792 aa29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 USP17L6PQ6QN14 398 aa29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 APBB2Q92870 758 aa29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 SPZ1Q9BXG8 430 aa29.48■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 SEMA3FQ13275 785 aa29.47■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 EPC2Q52LR7 807 aa29.47■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.47■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 TOP1MTQ969P6 601 aa29.47■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 MYL10Q9BUA6 226 aa29.47■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 SGSM2O43147 1006 aa29.46■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 ANTXR2P58335 489 aa29.46■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 TMEM31Q5JXX7 168 aa29.46■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 MAP3K14Q99558 947 aa29.46■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 SENP7Q9BQF6 1050 aa29.46■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.46■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 PLA2G5P39877 138 aa29.45■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 LEXMQ3ZCV2 418 aa29.45■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 TIGD5Q53EQ6 642 aa29.45■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 LMBR1Q8WVP7 490 aa29.45■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa29.45■■■□□ 2.31
E2F4-213ENST00000569573 NRCAMQ92823 1304 aa29.45■■■□□ 2.3
E2F4-213ENST00000569573 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
E2F4-213ENST00000569573 PIK3CDO00329 1044 aa29.44■■■□□ 2.3
E2F4-213ENST00000569573 GNAQP50148 359 aa29.44■■■□□ 2.3
E2F4-213ENST00000569573 GPM6BQ13491 265 aa29.44■■■□□ 2.3
E2F4-213ENST00000569573 LRFN3Q9BTN0 628 aa29.44■■■□□ 2.3
E2F4-213ENST00000569573 LY9Q9HBG7 655 aa29.44■■■□□ 2.3
E2F4-213ENST00000569573 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
E2F4-213ENST00000569573 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms