RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPRED2Q7Z698 418 aa22.4■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLA-CQ95604 372 aa22.4■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL9A1P20849 921 aa22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERVK-21P61565 698 aa22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEDD9Q14511 834 aa22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP26Q9BXU7 913 aa22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.39■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LGALS2P05162 132 aa22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXC8P31273 242 aa22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METTL7BQ6UX53 244 aa22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP3K14Q99558 947 aa22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INSL6Q9Y581 213 aa22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC01553A4QN01 128 aa22.37■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AMHP03971 560 aa22.37■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.37■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.37■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMARCA1P28370 1054 aa22.37■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.37■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FIBPO43427 364 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAND2O75155 1236 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNAT1P11488 350 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANTXR2P58335 489 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPRSQ13332 1948 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TREHO43280 583 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF5BP33176 963 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CUL5Q93034 780 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR20Q99678 358 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTA3Q9BTC8 594 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.35■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIK3CDO00329 1044 aa22.34■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEMA3FQ13275 785 aa22.34■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.34■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.34■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEPT8Q92599 483 aa22.34■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDAH1O94760 285 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNAQP50148 359 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NECTIN1Q15223 517 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMTC2Q8N394 836 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LY9Q9HBG7 655 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SETD4Q9NVD3 440 aa22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEIS2O14770 477 aa22.32■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC27A2O14975 620 aa22.32■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCM5P33992 734 aa22.32■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.32■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NLRX1Q86UT6 975 aa22.32■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 REC8O95072 547 aa22.31■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOP1MTQ969P6 601 aa22.31■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAM17P78536 824 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT32Q14532 448 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM26DQ5JW98 314 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM87BQ96K49 555 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAMD11Q96NU1 681 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYL10Q9BUA6 226 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.29■■□□□ 1.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRC1O43663 620 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms