RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
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CLSTN3-211ENST00000541667 BAIAP3O94812 1187 aa13.61□□□□□ -0.23
CLSTN3-211ENST00000541667 CA3P07451 260 aa13.61□□□□□ -0.23
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CLSTN3-211ENST00000541667 CALM2P0DP24 149 aa13.61□□□□□ -0.23
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CLSTN3-211ENST00000541667 ACTN1P12814 892 aa13.61□□□□□ -0.23
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CLSTN3-211ENST00000541667 SLC12A7Q9Y666 1083 aa13.61□□□□□ -0.23
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CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.6□□□□□ -0.23
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CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB103AP81534 67 aa13.6□□□□□ -0.23
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CLSTN3-211ENST00000541667 WWC2Q6AWC2 1192 aa13.58□□□□□ -0.24
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CLSTN3-211ENST00000541667 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
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CLSTN3-211ENST00000541667 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.56□□□□□ -0.24
CLSTN3-211ENST00000541667 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CLSTN3-211ENST00000541667 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.56□□□□□ -0.24
CLSTN3-211ENST00000541667 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
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CLSTN3-211ENST00000541667 RIC8AQ9NPQ8 531 aa13.56□□□□□ -0.24
CLSTN3-211ENST00000541667 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CLSTN3-211ENST00000541667 KIF28PB7ZC32 967 aa13.55□□□□□ -0.24
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