RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa16.53■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 CAND2O75155 1236 aa16.52■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 GGPS1O95749 300 aa16.52■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 APBB2Q92870 758 aa16.52■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.52■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.52■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 MYO7AQ13402 2215 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 TGFB3P10600 412 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 COL19A1Q14993 1142 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 RPAINQ86UA6 219 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.51■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 NEDD4P46934 1319 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 H3BRB1 525 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF213O14771 459 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 SORBS3O60504 671 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 CTSHP09668 335 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 GNAT1P11488 350 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 CTNNB1P35222 781 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 HSD17B4P51659 736 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 HIC1Q14526 733 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 FIBCD1Q8N539 461 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 PDCD2LQ9BRP1 358 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 AMNQ9BXJ7 453 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.5■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 RB1P06400 928 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 IRS1P35568 1242 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC22Q5TAA0 569 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa16.49■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 TREHO43280 583 aa16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 KDM4AO75164 1064 aa16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 CCND2P30279 289 aa16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 GHRHRQ02643 423 aa16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 PGM5Q15124 567 aa16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 STOX1Q6ZVD7 989 aa16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 IL17RAQ96F46 866 aa16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 C5orf67F2Z3F1 127 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 RGS20O76081 388 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 LGALS2P05162 132 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 HOXC8P31273 242 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAF1Q13077 416 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 GNPTABQ3T906 1256 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKS1AQ92625 1134 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 USP26Q9BXU7 913 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC3P53804 2025 aa16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 MBTPS2O43462 519 aa16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 LTBRP36941 435 aa16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 SP2Q02086 613 aa16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 CLUL1Q15846 466 aa16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.46■□□□□ 0.23
UBASH3B-202ENST00000525711 TECTAO75443 2155 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 USP34Q70CQ2 3546 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 B4E1Z4 1266 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 OPLAHO14841 1288 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 HYAL1Q12794 435 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 RILPL2Q969X0 211 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 PRRX2Q99811 253 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 UBAC1Q9BSL1 405 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.45■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
UBASH3B-202ENST00000525711 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms