RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 H3BRB1 525 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 TREHO43280 583 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 LGALS2P05162 132 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 GRM4Q14833 912 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 FCHSD1Q86WN1 690 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 HOMER1Q86YM7 354 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 RNPEPQ9H4A4 650 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 CYTH3O43739 400 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 CYP21A2P08686 494 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 KCNA5P22460 613 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 TRDNQ13061 729 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM178BQ8IXR5 827 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 TOP1MTQ969P6 601 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 BDP1A6H8Y1 2624 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 ICAM3P32942 547 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAF1Q13077 416 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 EPC2Q52LR7 807 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 SEPT8Q92599 483 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 MAP4K1Q92918 833 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 SAMD11Q96NU1 681 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 USP26Q9BXU7 913 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 SENP2Q9HC62 589 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 TRANK1O15050 2925 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 CAND2O75155 1236 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 CTSHP09668 335 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 IL9P15248 144 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 TROAPQ12815 778 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 SEMA3FQ13275 785 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 NEDD9Q14511 834 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 GNPTABQ3T906 1256 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 METTL7BQ6UX53 244 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 GJD3Q8N144 294 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 YME1L1Q96TA2 773 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 GPR20Q99678 358 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 SETD4Q9NVD3 440 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 H3BNC9 293 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 STAM2O75886 525 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 PTPROQ16827 1216 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 NEK9Q8TD19 979 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-205ENST00000502260 PTPRSQ13332 1948 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 GRXCR2A6NFK2 248 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 FIBPO43427 364 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 UPP2O95045 317 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 GNAT1P11488 350 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 ADAM17P78536 824 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 GPM6BQ13491 265 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM26DQ5JW98 314 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 TRIM50Q86XT4 487 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM192Q8IY95 271 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 NCOA7Q8NI08 942 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 APBB2Q92870 758 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 ERICH2A1L162 156 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 E7EWF7 191 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 WTAPQ15007 396 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 TCEAL5Q5H9L2 206 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 CASC1Q6TDU7 716 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 BANK1Q8NDB2 785 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 CDC45O75419 566 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-205ENST00000502260 ARHGAP4P98171 946 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms