RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 SP2Q02086 613 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 PTPROQ16827 1216 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 EPC2Q52LR7 807 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 EP400NLQ6ZTU2 488 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.63□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 ALADP13716 330 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 NT5C2P49902 561 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 GHRHRQ02643 423 aa13.62□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 NEK9Q8TD19 979 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 SEPT8Q92599 483 aa13.62□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 TOP1MTQ969P6 601 aa13.61□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB5O15062 677 aa13.6□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 HOXC8P31273 242 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 MTMR8Q96EF0 704 aa13.59□□□□□ -0.23
RABGEF1-207ENST00000484547 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
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RABGEF1-207ENST00000484547 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-207ENST00000484547 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-207ENST00000484547 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-207ENST00000484547 SAMD3Q8N6K7 520 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-207ENST00000484547 USP26Q9BXU7 913 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM50BQ9Y247 325 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-207ENST00000484547 TTC3P53804 2025 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGEF1-207ENST00000484547 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
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