RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481987.5

CEP170-215, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5 BASIC

Gene CEP170, Length 3,031 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-215	ENST00000481987	PRPH	P41219	470 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	ADCY7	P51828	1080 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987		Q3C1V9	767 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	BRF1	Q92994	677 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987		A0A1W2PPC1	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	MEIS2	O14770	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	FIBP	O43427	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	ATG7	O95352	703 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	CYP2C8	P10632	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	COL6A1	P12109	1028 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	CTGF	P29279	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	LBX1	P52954	281 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	NEDD9	Q14511	834 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	STXBP2	Q15833	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	RIT2	Q99578	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP170-215	ENST00000481987	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	LGR5	O75473	907 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	CDC27	P30260	824 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	SCRN1	Q12765	414 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	COBL	O75128	1261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	LYPLA2	O95372	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	MMP1	P03956	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	SFN	P31947	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	RFC2	P35250	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	GCGR	P47871	477 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	FLT3LG	P49771	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	CPT1A	P50416	773 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	PGM5	Q15124	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	PIGS	Q96S52	555 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	PORCN	Q9H237	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987		A6NJR5	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	MEIS1	O00470	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	CPLX1	O14810	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	SGPL1	O95470	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	ABCD1	P33897	745 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP170-215	ENST00000481987	NEK4	P51957	841 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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