RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF76P36508 570 aa23.47■■□□□ 1.35
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RPUSD3-210ENST00000460909 DGKDQ16760 1214 aa23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 KAT2BQ92831 832 aa23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 LENG9Q96B70 501 aa23.47■■□□□ 1.35
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RPUSD3-210ENST00000460909 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.46■■□□□ 1.35
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RPUSD3-210ENST00000460909 NR5A1Q13285 461 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD3-210ENST00000460909 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
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RPUSD3-210ENST00000460909 CYP3A7P24462 503 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD3-210ENST00000460909 INF2Q27J81 1249 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD3-210ENST00000460909 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.44■■□□□ 1.34
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RPUSD3-210ENST00000460909 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.42■■□□□ 1.34
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RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF286BP0CG31 522 aa23.42■■□□□ 1.34
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RPUSD3-210ENST00000460909 ACTR2P61160 394 aa23.38■■□□□ 1.33
RPUSD3-210ENST00000460909 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RPUSD3-210ENST00000460909 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.38■■□□□ 1.33
RPUSD3-210ENST00000460909 LETM2Q2VYF4 491 aa23.38■■□□□ 1.33
RPUSD3-210ENST00000460909 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.38■■□□□ 1.33
RPUSD3-210ENST00000460909 TRIM50Q86XT4 487 aa23.38■■□□□ 1.33
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC5A5Q92911 643 aa23.38■■□□□ 1.33
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