RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 ITGA1P56199 1179 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 C20orf173Q96LM9 149 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 SYT3Q9BQG1 590 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 SPATA25Q9BR10 227 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 SLC27A2O14975 620 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 COL6A2P12110 1019 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 PAK1Q13153 545 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 NFIXQ14938 502 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 LCE1DQ5T752 114 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 TEPPQ6URK8 271 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 STK32CQ86UX6 486 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 RELTQ969Z4 430 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 EXOC2Q96KP1 924 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 DNAJC7Q99615 494 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 USP40Q9NVE5 1235 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-210ENST00000425184 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 LRG1P02750 347 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 NAT1P18440 290 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 GJA9P57773 515 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 GABREP78334 506 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 TEPSINQ96N21 525 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 CLIC6Q96NY7 704 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 IPPKQ9H8X2 491 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 DSEQ9UL01 958 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 GUCY1A3Q02108 690 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 GRIN1Q05586 938 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 TUSC3Q13454 348 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 TMEM209Q96SK2 561 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 NOBOXO60393 691 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 CYP7B1O75881 506 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 APPP05067 770 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 ADAM9Q13443 819 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 ERICH6BQ5W0A0 696 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 WRNIP1Q96S55 665 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 SCRIBQ14160 1630 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 WNT9AO14904 365 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 NFE2L2Q16236 605 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 RGL3Q3MIN7 710 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 PRR31Q5SQ13 230 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 KCTD1Q719H9 257 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 PCDH19Q8TAB3 1148 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 CXorf38Q8TB03 319 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 FBXW5Q969U6 566 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 ARVCFO00192 962 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 GSTA4O15217 222 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 EFCAB14O75071 495 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 LTFP02788 710 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 FAHP16930 419 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 SYN1P17600 705 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 EPHA5P54756 1037 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 VASNQ6EMK4 673 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 FAM124AQ86V42 546 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 JMYQ8N9B5 988 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 LNPKQ9C0E8 428 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 NDOR1Q9UHB4 597 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-210ENST00000425184 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms