RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 FAM122AQ96E09 287 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SEPT8Q92599 483 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 YME1L1Q96TA2 773 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 CYTH3O43739 400 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 CYP21A2P08686 494 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 PTH1RQ03431 593 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 TTC22Q5TAA0 569 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 NCOA7Q8NI08 942 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 SETD4Q9NVD3 440 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-202ENST00000415164 KCNA5P22460 613 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 PDE4AP27815 886 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 NEDD9Q14511 834 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 TRIM50Q86XT4 487 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 E7EWF7 191 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP4P98171 946 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 CUL5Q93034 780 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 USP26Q9BXU7 913 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 NCOR1O75376 2440 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 FIBPO43427 364 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 GNAT1P11488 350 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 PLA2G5P39877 138 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 METTL7BQ6UX53 244 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 GPR20Q99678 358 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 MYL10Q9BUA6 226 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 TROAPQ12815 778 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 PTPROQ16827 1216 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 EPC2Q52LR7 807 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.167e-12■■□□□ 12.9
UBXN4-202ENST00000415164 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 STAM2O75886 525 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 CHMLP26374 656 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 SEMA3FQ13275 785 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 ICAM3P32942 547 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 GPM6BQ13491 265 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 NLRX1Q86UT6 975 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN4-202ENST00000415164 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 CAND2O75155 1236 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 CSPG5O95196 566 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 IL9P15248 144 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 HOXC8P31273 242 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 ANTXR2P58335 489 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 CASC1Q6TDU7 716 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 TOP1MTQ969P6 601 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 SAMD11Q96NU1 681 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 CD320Q9NPF0 282 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 SIP14410 1827 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 GHRP10912 638 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 MARK3P27448 753 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 KIF5BP33176 963 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM192Q8IY95 271 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 CTNNB1P35222 781 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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