RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.93■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 TRAF5O00463 557 aa30.93■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 RXRBP28702 533 aa30.93■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 CCDC181Q5TID7 509 aa30.93■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 CCDC65Q8IXS2 484 aa30.93■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 MTMR8Q96EF0 704 aa30.93■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 DRC1Q96MC2 740 aa30.93■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 ATAD5Q96QE3 1844 aa30.93■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 MYH10P35580 1976 aa30.92■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 SERPING1P05155 500 aa30.92■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 PAFAH1B1P43034 410 aa30.92■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.92■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 SFMBT2Q5VUG0 894 aa30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 NFRKBQ6P4R8 1299 aa30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB9Q96C00 473 aa30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 PSTPIP2Q9H939 334 aa30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 RNF14Q9UBS8 474 aa30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 GGCXP38435 758 aa30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 GTF2IP78347 998 aa30.91■■■□□ 2.54
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UBP1-201ENST00000283628 LRRC1Q9BTT6 524 aa30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 MMP10P09238 476 aa30.9■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6BA6NDN3 693 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF8P28908 595 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 PDE6BP35913 854 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 FAM83BQ5T0W9 1011 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 MYH4Q9Y623 1939 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 NOL4O94818 638 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 SLC1A4P43007 532 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 ATP2B2Q01814 1243 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 RASSF7Q02833 373 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 CLEC10AQ8IUN9 316 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 TRIM59Q8IWR1 403 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 TLR10Q9BXR5 811 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 SALL4Q9UJQ4 1053 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa30.89■■■□□ 2.54
UBP1-201ENST00000283628 AGPSO00116 658 aa30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 COA1Q9GZY4 146 aa30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 SHMT1P34896 483 aa30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 EPHB4P54760 987 aa30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 TTBK2Q6IQ55 1244 aa30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 STIM2Q9P246 746 aa30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP30.88■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 ALDH1B1P30837 517 aa30.87■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 EMBQ6PCB8 327 aa30.87■■■□□ 2.53
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UBP1-201ENST00000283628 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 NLRC4Q9NPP4 1024 aa30.87■■■□□ 2.53
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UBP1-201ENST00000283628 USP11P51784 963 aa30.86■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 LRRC31Q6UY01 552 aa30.86■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 SRLQ86TD4 932 aa30.86■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 USP17L10C9JJH3 530 aa30.86■■■□□ 2.53
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UBP1-201ENST00000283628 ERCC3P19447 782 aa30.86■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 CFAP221Q4G0U5 840 aa30.86■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 HDAC7Q8WUI4 952 aa30.86■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1024Q9UPX6 916 aa30.86■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.85■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 TLR2O60603 784 aa30.85■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 SLC20A2Q08357 652 aa30.85■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 EDRF1Q3B7T1 1238 aa30.85■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 HAUS3Q68CZ6 603 aa30.85■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 KCNMB3Q9NPA1 279 aa30.85■■■□□ 2.53
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UBP1-201ENST00000283628 GPBP1Q86WP2 473 aa30.85■■■□□ 2.53
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UBP1-201ENST00000283628 KCTD10Q9H3F6 313 aa30.85■■■□□ 2.53
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UBP1-201ENST00000283628 CYP3A7P24462 503 aa30.84■■■□□ 2.53
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UBP1-201ENST00000283628 C8orf74Q6P047 294 aa30.84■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa30.84■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 FAM76AQ8TAV0 307 aa30.84■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 TRERF1Q96PN7 1200 aa30.84■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 USP40Q9NVE5 1235 aa30.84■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 NCK2O43639 380 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 SLC18A3Q16572 532 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
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