RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 FIBPO43427 364 aa24.97■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 RPS6KB1P23443 525 aa24.97■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 APOBRQ0VD83 1088 aa24.97■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 UBE2SQ16763 222 aa24.97■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 NLRX1Q86UT6 975 aa24.97■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.97■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 PPFIA4O75335 1185 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 PSEN2P49810 448 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 SP2Q02086 613 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 NEDD9Q14511 834 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 PTGISQ16647 500 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 RETREG2Q8NC44 543 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 KAT2BQ92831 832 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 ALG1Q9BT22 464 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 PTPRSQ13332 1948 aa24.96■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.95■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 MFSD10Q14728 455 aa24.95■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.95■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.95■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.95■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.95■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.94■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 F2P00734 622 aa24.94■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 COL9A1P20849 921 aa24.94■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 CDC27P30260 824 aa24.94■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 ICAM3P32942 547 aa24.94■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 BFSP2Q13515 415 aa24.94■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.94■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 CA3P07451 260 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 ADCY7P51828 1080 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 FUT2Q10981 343 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 METTL7BQ6UX53 244 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 SESTD1Q86VW0 696 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 CDHR1Q96JP9 859 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.93■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 PITPNM1O00562 1244 aa24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 ACTN1P12814 892 aa24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 RFC2P35250 354 aa24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 IL27Q8NEV9 243 aa24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.92■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 RFXAPO00287 272 aa24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 IQCF3P0C7M6 154 aa24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 SP4Q02446 784 aa24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 FBXL16Q8N461 479 aa24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 GPRASP2Q96D09 838 aa24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 SLC9A7Q96T83 725 aa24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 BARHL2Q9NY43 387 aa24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.91■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 SMCO2A6NFE2 343 aa24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 EPOPA6NHQ4 379 aa24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 STXBP3O00186 592 aa24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 SEMA3FQ13275 785 aa24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 RUFY3Q7L099 469 aa24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 CAGE1Q8TC20 777 aa24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 USP26Q9BXU7 913 aa24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 CERS4Q9HA82 394 aa24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 ARHGEF15O94989 841 aa24.89■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 LGALS2P05162 132 aa24.89■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 TFF2Q03403 129 aa24.89■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 MTMR1Q13613 665 aa24.89■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.89■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.89■■□□□ 1.58
NME4-201ENST00000219479 H3BRB1 525 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 HAS3O00219 553 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 SCG2P13521 617 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.571e-11■■■■■ 53.6
NME4-201ENST00000219479 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NME4-201ENST00000219479 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms