RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000036229.12

Ctdp1-201, Transcript of RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdp1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Usp53P15975 1069 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Aggf1Q7TN31 711 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ubap1Q8BH48 502 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccdc65Q8VHI7 493 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fam171a1A2ATK9 892 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm6588E9Q3K0 461 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 CraddO88843 199 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Stmn2P55821 179 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Armcx3Q8BHS6 379 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ppm1mQ8BU27 406 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Trim68Q8K243 485 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gimap7Q8R379 293 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rsph3bQ9DA80 389 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cul3Q9JLV5 768 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 MypnQ5DTJ9 1315 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Akr1b7P21300 316 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 GssP51855 474 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Flt3Q00342 1000 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pls1Q3V0K9 630 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dhx37Q6NZL1 1150 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rnf41Q8BH75 317 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ophn1Q99J31 802 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fgfr1op2Q9CRA9 253 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Spata17Q9D552 379 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Skor2A7M7C7 1008 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ctnnal1O88327 731 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gpr182P43142 395 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 BC051142Q3V0M8 400 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cyp7a1Q64505 503 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Haus4Q8BFT2 363 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Terb1Q8C0V1 768 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccdc91Q9D8L5 442 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Git2Q9JLQ2 708 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Prl3d2F6R3P9 224 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Casp1P29452 402 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Man1a2P39098 641 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Wdr91Q7TMQ7 748 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Glrx3Q9CQM9 337 aa15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Krt24A1L317 512 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Prl2c2P04095 224 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 PrphP15331 475 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Krt19P19001 403 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Adck2Q6NSR3 617 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tmem60Q8K174 133 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf287Q9EQB9 759 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ulk4Q3V129 1303 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm6121L7MUF1 212 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Lrrc23O35125 340 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ephb4P54761 987 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Jdp2P97875 163 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Esyt3Q5DTI8 891 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slitrk3Q810B9 980 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc5a1Q8C3K6 665 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rnf4Q9QZS2 194 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Hao1Q9WU19 370 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cog1Q9Z160 980 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Med23Q80YQ2 1367 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm5936A2BG95 728 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm5640A3KG49 728 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccdc110Q3V125 848 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rnf220Q6PDX6 566 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pkn3Q8K045 878 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cdk9Q99J95 372 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Calml3Q9D6P8 149 aa15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Grik3B1AS29 919 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pold1P52431 1105 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ezh1P70351 747 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nlrp4eQ66X19 978 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Wasf2Q8BH43 497 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Lrrc4cQ8C031 640 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tmem120aQ8C1E7 343 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Syce1Q9D495 329 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Spata1Q9D5R4 444 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cyp3a25O09158 503 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sap30bpQ02614 308 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Traf3ip1Q149C2 625 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Asap3Q5U464 904 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Riok1Q922Q2 567 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slfn8B1ARD8 910 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mucl2P02815 138 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Usp17leQ7M764 540 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 AdalQ80SY6 360 aa15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rimbp2Q80U40 1072 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.8 ms