Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA9

Fgfr1op2, FGFR1 oncogene partner 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1op2Q9CRA9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Fgfr1op2Q9CRA9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Fgfr1op2Q9CRA9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Fgfr1op2Q9CRA9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,73■■■□□ 2,83
Fgfr1op2Q9CRA9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,69■■■□□ 2,82
Fgfr1op2Q9CRA9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Fgfr1op2Q9CRA9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Fgfr1op2Q9CRA9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Fgfr1op2Q9CRA9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Fgfr1op2Q9CRA9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Fgfr1op2Q9CRA9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Fgfr1op2Q9CRA9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Fgfr1op2Q9CRA9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Fgfr1op2Q9CRA9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Fgfr1op2Q9CRA9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Fgfr1op2Q9CRA9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Fgfr1op2Q9CRA9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Fgfr1op2Q9CRA9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Fgfr1op2Q9CRA9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Fgfr1op2Q9CRA9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Fgfr1op2Q9CRA9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Fgfr1op2Q9CRA9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Fgfr1op2Q9CRA9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Fgfr1op2Q9CRA9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Fgfr1op2Q9CRA9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Fgfr1op2Q9CRA9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Fgfr1op2Q9CRA9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Fgfr1op2Q9CRA9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Fgfr1op2Q9CRA9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Fgfr1op2Q9CRA9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Fgfr1op2Q9CRA9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Fgfr1op2Q9CRA9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Fgfr1op2Q9CRA9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Fgfr1op2Q9CRA9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Fgfr1op2Q9CRA9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Fgfr1op2Q9CRA9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Fgfr1op2Q9CRA9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Fgfr1op2Q9CRA9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Fgfr1op2Q9CRA9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Fgfr1op2Q9CRA9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Fgfr1op2Q9CRA9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Fgfr1op2Q9CRA9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Fgfr1op2Q9CRA9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Fgfr1op2Q9CRA9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Fgfr1op2Q9CRA9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Fgfr1op2Q9CRA9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Fgfr1op2Q9CRA9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Fgfr1op2Q9CRA9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Fgfr1op2Q9CRA9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Fgfr1op2Q9CRA9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Fgfr1op2Q9CRA9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Fgfr1op2Q9CRA9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Fgfr1op2Q9CRA9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Fgfr1op2Q9CRA9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Fgfr1op2Q9CRA9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Fgfr1op2Q9CRA9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Fgfr1op2Q9CRA9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Fgfr1op2Q9CRA9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Fgfr1op2Q9CRA9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Fgfr1op2Q9CRA9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Fgfr1op2Q9CRA9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Fgfr1op2Q9CRA9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Fgfr1op2Q9CRA9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2,07
Fgfr1op2Q9CRA9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Fgfr1op2Q9CRA9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Fgfr1op2Q9CRA9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Fgfr1op2Q9CRA9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Fgfr1op2Q9CRA9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Fgfr1op2Q9CRA9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Fgfr1op2Q9CRA9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Fgfr1op2Q9CRA9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Fgfr1op2Q9CRA9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Fgfr1op2Q9CRA9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Fgfr1op2Q9CRA9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Fgfr1op2Q9CRA9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Fgfr1op2Q9CRA9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Fgfr1op2Q9CRA9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Fgfr1op2Q9CRA9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Fgfr1op2Q9CRA9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Fgfr1op2Q9CRA9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Fgfr1op2Q9CRA9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Fgfr1op2Q9CRA9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Fgfr1op2Q9CRA9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Fgfr1op2Q9CRA9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Fgfr1op2Q9CRA9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Fgfr1op2Q9CRA9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms