Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
Traf3ip1Q149C2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Traf3ip1Q149C2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Traf3ip1Q149C2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Traf3ip1Q149C2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Traf3ip1Q149C2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Traf3ip1Q149C2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Traf3ip1Q149C2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Traf3ip1Q149C2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Traf3ip1Q149C2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Traf3ip1Q149C2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Traf3ip1Q149C2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Traf3ip1Q149C2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Traf3ip1Q149C2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Traf3ip1Q149C2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Traf3ip1Q149C2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Traf3ip1Q149C2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Traf3ip1Q149C2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Traf3ip1Q149C2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Traf3ip1Q149C2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Traf3ip1Q149C2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Traf3ip1Q149C2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Traf3ip1Q149C2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Traf3ip1Q149C2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Traf3ip1Q149C2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Traf3ip1Q149C2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Traf3ip1Q149C2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Traf3ip1Q149C2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Traf3ip1Q149C2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Traf3ip1Q149C2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Traf3ip1Q149C2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Traf3ip1Q149C2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Traf3ip1Q149C2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Traf3ip1Q149C2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Traf3ip1Q149C2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Traf3ip1Q149C2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Traf3ip1Q149C2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Traf3ip1Q149C2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Traf3ip1Q149C2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Traf3ip1Q149C2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Traf3ip1Q149C2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Traf3ip1Q149C2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Traf3ip1Q149C2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Traf3ip1Q149C2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Traf3ip1Q149C2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Traf3ip1Q149C2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Traf3ip1Q149C2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Traf3ip1Q149C2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Traf3ip1Q149C2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Traf3ip1Q149C2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Traf3ip1Q149C2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Traf3ip1Q149C2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Traf3ip1Q149C2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Traf3ip1Q149C2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Traf3ip1Q149C2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Traf3ip1Q149C2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Traf3ip1Q149C2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Traf3ip1Q149C2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Traf3ip1Q149C2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Traf3ip1Q149C2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Traf3ip1Q149C2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Traf3ip1Q149C2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Traf3ip1Q149C2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Traf3ip1Q149C2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Traf3ip1Q149C2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Traf3ip1Q149C2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Traf3ip1Q149C2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Traf3ip1Q149C2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Traf3ip1Q149C2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Traf3ip1Q149C2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Traf3ip1Q149C2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Traf3ip1Q149C2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Traf3ip1Q149C2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Traf3ip1Q149C2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Traf3ip1Q149C2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Traf3ip1Q149C2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Traf3ip1Q149C2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Traf3ip1Q149C2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Traf3ip1Q149C2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Traf3ip1Q149C2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Traf3ip1Q149C2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Traf3ip1Q149C2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Traf3ip1Q149C2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Traf3ip1Q149C2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Traf3ip1Q149C2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Traf3ip1Q149C2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Traf3ip1Q149C2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Traf3ip1Q149C2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Traf3ip1Q149C2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Traf3ip1Q149C2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Traf3ip1Q149C2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Traf3ip1Q149C2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Traf3ip1Q149C2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Traf3ip1Q149C2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Traf3ip1Q149C2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Traf3ip1Q149C2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Traf3ip1Q149C2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Traf3ip1Q149C2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
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