RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M TMA46Q12000 345 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR223WQ12015 292 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M PUS9Q12069 462 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MDM32Q12171 622 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR342CQ12182 319 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN5Q12250 445 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M NTO1Q12311 748 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M NSI1Q12457 570 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP8P33334 2413 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR085WP0CF18 432 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M HSC82P15108 705 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M SAC7P17121 654 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GLK1P17709 500 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M RPB10P22139 70 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GPI12P23797 304 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PTC6P25646 442 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PMT2P31382 759 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M RPT5P33297 434 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS1AP33442 255 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M RIM2P38127 377 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M SEA4P38164 1038 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M BNA4P38169 460 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data2.46□□□□□ -2.02not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M LIN1P38852 340 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M AXL2P38928 823 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM2P39721 246 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL057CP39983 233 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M ICE2P40499 491 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL001WP40560 513 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M CIN1P40987 1014 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GCD10P41814 478 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP6P43593 499 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PMT4P46971 762 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M MAD3P47074 515 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M SPT20P50875 604 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GTR2P53290 341 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M MPS1P54199 764 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M REX2P54964 269 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M SDH1Q00711 640 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M SLT2Q00772 484 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL109CQ02981 657 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YML131WQ03102 365 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR209CQ03480 137 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GAS3Q03655 524 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP45Q07651 309 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M NOB1Q08444 459 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M BAG7Q12128 409 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M AHA1Q12449 350 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M HAA1Q12753 694 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YCL012CQ8J0M4 134 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR019WQ99248 730 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GCN1P33892 2672 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M ATP4P05626 244 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M RHO2P06781 192 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PET111P08468 800 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M DAP2P18962 818 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GRR1P24814 1151 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M SLM5P25345 492 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M ILV6P25605 309 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M ARE1P25628 610 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M BUB2P26448 306 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M CMK1P27466 446 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M BUD14P27637 709 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PTR2P32901 601 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M LST4P34239 828 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M OAF3P36023 863 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M BET3P36149 193 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M MNN2P38069 597 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR071WP38243 211 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M IFA38P38286 347 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M DMA1P38823 416 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GPI16P38875 610 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M RIX1P38883 763 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YHB1P39676 399 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL020CP39994 560 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PFK26P40433 827 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PTR3P43606 678 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M MET12P46151 657 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M TIM54P47045 478 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR039WP47107 1121 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M LIA1P47120 325 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M ROM1P53046 1155 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M CDH1P53197 566 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M NOP19P53317 196 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL068CQ02749 293 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG21Q02887 496 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GIP3Q03016 1276 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M ATP25Q03153 612 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS16Q03308 798 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M CGI121Q03705 181 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M PUN1Q06991 263 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M NMD4Q12129 218 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)MtW(CCA)M GLO4Q12320 285 aa2.45□□□□□ -2.02
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