RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K TMA46Q12000 345 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR223WQ12015 292 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K PUS9Q12069 462 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K MDM32Q12171 622 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR342CQ12182 319 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K RPN5Q12250 445 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K NTO1Q12311 748 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K NSI1Q12457 570 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP8P33334 2413 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR085WP0CF18 432 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K HSC82P15108 705 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SAC7P17121 654 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GLK1P17709 500 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RPB10P22139 70 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GPI12P23797 304 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PTC6P25646 442 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PMT2P31382 759 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RPT5P33297 434 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS1AP33442 255 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RIM2P38127 377 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SEA4P38164 1038 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K BNA4P38169 460 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data2.46□□□□□ -2.02not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K LIN1P38852 340 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K AXL2P38928 823 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM2P39721 246 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YEL057CP39983 233 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ICE2P40499 491 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YIL001WP40560 513 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CIN1P40987 1014 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GCD10P41814 478 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K UBP6P43593 499 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PMT4P46971 762 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MAD3P47074 515 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SPT20P50875 604 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GTR2P53290 341 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MPS1P54199 764 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K REX2P54964 269 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SDH1Q00711 640 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SLT2Q00772 484 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL109CQ02981 657 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YML131WQ03102 365 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR209CQ03480 137 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GAS3Q03655 524 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K FMP45Q07651 309 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K NOB1Q08444 459 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K BAG7Q12128 409 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K AHA1Q12449 350 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K HAA1Q12753 694 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YCL012CQ8J0M4 134 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR019WQ99248 730 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GCN1P33892 2672 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ATP4P05626 244 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RHO2P06781 192 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PET111P08468 800 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K DAP2P18962 818 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GRR1P24814 1151 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K SLM5P25345 492 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ILV6P25605 309 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ARE1P25628 610 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K BUB2P26448 306 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CMK1P27466 446 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K BUD14P27637 709 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PTR2P32901 601 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K LST4P34239 828 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K OAF3P36023 863 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K BET3P36149 193 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MNN2P38069 597 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR071WP38243 211 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K IFA38P38286 347 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K DMA1P38823 416 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GPI16P38875 610 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K RIX1P38883 763 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YHB1P39676 399 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YEL020CP39994 560 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PFK26P40433 827 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PTR3P43606 678 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MET12P46151 657 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K TIM54P47045 478 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR039WP47107 1121 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K LIA1P47120 325 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ROM1P53046 1155 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CDH1P53197 566 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K NOP19P53317 196 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL068CQ02749 293 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG21Q02887 496 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GIP3Q03016 1276 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K ATP25Q03153 612 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS16Q03308 798 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K CGI121Q03705 181 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K PUN1Q06991 263 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K NMD4Q12129 218 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)KtW(CCA)K GLO4Q12320 285 aa2.45□□□□□ -2.02
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