RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J TMA46Q12000 345 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR223WQ12015 292 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PUS9Q12069 462 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MDM32Q12171 622 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR342CQ12182 319 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPN5Q12250 445 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NTO1Q12311 748 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NSI1Q12457 570 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP8P33334 2413 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR085WP0CF18 432 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J HSC82P15108 705 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SAC7P17121 654 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GLK1P17709 500 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPB10P22139 70 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI12P23797 304 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PTC6P25646 442 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PMT2P31382 759 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPT5P33297 434 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS1AP33442 255 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM2P38127 377 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SEA4P38164 1038 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J BNA4P38169 460 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data2.46□□□□□ -2.02not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J LIN1P38852 340 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J AXL2P38928 823 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM2P39721 246 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL057CP39983 233 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ICE2P40499 491 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL001WP40560 513 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CIN1P40987 1014 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GCD10P41814 478 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP6P43593 499 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PMT4P46971 762 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MAD3P47074 515 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SPT20P50875 604 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GTR2P53290 341 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MPS1P54199 764 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J REX2P54964 269 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SDH1Q00711 640 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SLT2Q00772 484 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL109CQ02981 657 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YML131WQ03102 365 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR209CQ03480 137 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GAS3Q03655 524 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP45Q07651 309 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J NOB1Q08444 459 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J BAG7Q12128 409 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J AHA1Q12449 350 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J HAA1Q12753 694 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YCL012CQ8J0M4 134 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR019WQ99248 730 aa2.46□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GCN1P33892 2672 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP4P05626 244 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RHO2P06781 192 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PET111P08468 800 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J DAP2P18962 818 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GRR1P24814 1151 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SLM5P25345 492 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ILV6P25605 309 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ARE1P25628 610 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J BUB2P26448 306 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CMK1P27466 446 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD14P27637 709 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PTR2P32901 601 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J LST4P34239 828 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J OAF3P36023 863 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J BET3P36149 193 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MNN2P38069 597 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR071WP38243 211 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J IFA38P38286 347 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J DMA1P38823 416 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI16P38875 610 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RIX1P38883 763 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YHB1P39676 399 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL020CP39994 560 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PFK26P40433 827 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PTR3P43606 678 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MET12P46151 657 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TIM54P47045 478 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR039WP47107 1121 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J LIA1P47120 325 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ROM1P53046 1155 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CDH1P53197 566 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP19P53317 196 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL068CQ02749 293 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG21Q02887 496 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GIP3Q03016 1276 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP25Q03153 612 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS16Q03308 798 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CGI121Q03705 181 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PUN1Q06991 263 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J NMD4Q12129 218 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GLO4Q12320 285 aa2.45□□□□□ -2.02
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