RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	NYV1	Q12255	253 aa		0.63	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	RAV1	P47104	1357 aa		0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	HIR2	P32480	875 aa		0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	ALG5	P40350	334 aa		0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	YFR057W	P43625	151 aa		0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	AIM22	P47051	409 aa		0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	YML037C	Q03703	340 aa		0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	RAD30	Q04049	632 aa		0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	SOV1	Q04748	898 aa		0.62	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	ITR1	P30605	584 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	PFF1	P38244	976 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	WSS1	P38838	269 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	ERP2	P39704	215 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	NUP116	Q02630	1113 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	YMR102C	Q03177	834 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	SNO4	Q04902	237 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	VID22	Q05934	901 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.61	□□□□□ -2.31	not detected
snR46	snR46	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	HSP32	Q08992	237 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	YOL087C	Q99247	1116 aa		0.61	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	ELO2	P25358	347 aa		0.6	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	STP2	P38704	541 aa		0.6	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	LCL3	P53153	274 aa		0.6	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	RPN14	P53196	417 aa		0.6	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	YPR096C	O13587	100 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	POL4	P25615	582 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	CDC50	P25656	391 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	PEP3	P27801	918 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	SLC1	P33333	303 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	OM14	P38325	134 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	YER010C	P40011	234 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	FRE4	P53746	719 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	SLG1	P54867	378 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	YET2	Q04210	160 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	HRT1	Q08273	121 aa		0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
snR46	snR46	SSM4	P40318	1319 aa		0.59	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	GAT2	P40209	560 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	YIR035C	P40579	254 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	BNA1	P47096	177 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	PGU1	P47180	361 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	DSL1	P53847	754 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	HOT1	Q03213	719 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	ECM7	Q06200	448 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	PIN3	Q06449	215 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	YPL272C	Q08984	517 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	YDR061W	Q12298	539 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	SKM1	Q12469	655 aa		0.58	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	ATP4	P05626	244 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	SKN1	P33336	771 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	YBL029W	P38201	376 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	FRT2	P39734	528 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	CPR7	P47103	393 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	VID30	P53076	958 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	IOC4	Q04213	475 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	MFB1	Q04922	465 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	VPS38	Q05919	439 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	RIF2	Q06208	395 aa		0.57	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	MSI1	P13712	422 aa		0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	YIL029C	P40538	142 aa		0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	SIP4	P46954	829 aa		0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	ECM27	P47144	725 aa		0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	YNR048W	P53740	393 aa		0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	YDR387C	Q04162	555 aa		0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	SPE4	Q12455	300 aa		0.56	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	PUT4	P15380	627 aa		0.55	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	RPB5	P20434	215 aa		0.55	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	DBF20	P32328	564 aa		0.55	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	PSY4	P38193	441 aa		0.55	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	0.55	□□□□□ -2.32	RIP-Chip
snR46	snR46	STB1	P42845	420 aa		0.55	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	UTR5	P32630	166 aa		0.54	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	SPO73	P40031	143 aa		0.54	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	IGD1	P43598	195 aa		0.54	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	AZR1	P50080	613 aa		0.54	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	ZRC1	P20107	442 aa		0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	ECM25	P32525	599 aa		0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	ECT1	P33412	323 aa		0.53	□□□□□ -2.32

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.7 ms